RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 CREB1P16220 341 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 CD38P28907 300 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 TM4SF4P48230 202 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 PICALMQ13492 652 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 KRT28Q7Z3Y7 464 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 HASPINQ8TF76 798 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 DPF1Q92782 380 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 MMS19Q96T76 1030 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 SLC25A32Q9H2D1 315 aa8.09□□□□□ -1.11
SGCE-210ENST00000472326 WIPF3A6NGB9 483 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CLCA1A8K7I4 914 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 RASA4BC9J798 803 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 AREL1O15033 823 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 RASA4O43374 803 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SNX2O60749 519 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 NDST3O95803 873 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 C21orf58P58505 322 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 BEND5Q7L4P6 421 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa8.08□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 DIO1P49895 249 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 RENBPP51606 427 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 LMAN2Q12907 356 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 FHL3Q13643 280 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PROSER3Q2NL68 480 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MZT2AQ6P582 158 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 DDB2Q92466 427 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 FAM227BQ96M60 508 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MAGEB5Q9BZ81 275 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CHST12Q9NRB3 414 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.07□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 TISP43B9A030 160 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 RBL1P28749 1068 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MCM5P33992 734 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 AK2P54819 239 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 DEUP1Q05D60 604 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ARL13BQ3SXY8 428 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 DPP9Q86TI2 863 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 OR2C3Q8N628 320 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CCDC138Q96M89 665 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SNX18Q96RF0 628 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MGAT4CQ9UBM8 478 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.06□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 LINC01548A6NM66 108 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PRKCGP05129 697 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MYL4P12829 197 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 HTR7P34969 479 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 COPB1P53618 953 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 COPAP53621 1224 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PTF1AQ7RTS3 328 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CHSY1Q86X52 802 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CCDC146Q8IYE0 955 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CCDC150Q8NCX0 1101 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ASIC5Q9NY37 505 aa8.05□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ARP10275 920 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CD19P15391 556 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CCDC142Q17RM4 750 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SLC35G1Q2M3R5 365 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SRLQ86TD4 932 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SFTPA1Q8IWL2 248 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 KIAA1191Q96A73 305 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 RITA1Q96K30 269 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 MYD88Q99836 296 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 TRIM36Q9NQ86 728 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa8.04□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 M0R3H8 397 aa8.03□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 FGF18O76093 207 aa8.03□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 GABRB3P28472 473 aa8.03□□□□□ -1.12
SGCE-210ENST00000472326 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
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