RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471572.6

NF1-208, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 2

Gene NF1, Length 2,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-208ENST00000471572 RARSP54136 660 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SP140Q13342 867 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FHL3Q13643 280 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CAMK1Q14012 370 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 IRF3Q14653 427 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ADIPOQQ15848 244 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TEX9Q8N6V9 391 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FAM46DQ8NEK8 389 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 NETO1Q8TDF5 533 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FAM227BQ96M60 508 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 UIMC1Q96RL1 719 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 NDC1Q9BTX1 674 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 JKAMPQ9P055 326 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 E9PLN8 166 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SLC4A1P02730 911 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CYBBP04839 570 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 C6P13671 934 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 IFNAR1P17181 557 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ATP5DP30049 168 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CD86P42081 329 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 STPG3Q8N7X2 389 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FRMD1Q8N878 549 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TMIEQ8NEW7 156 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.64□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CHD1O14646 1710 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 C9orf172C9J069 976 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 QDPRP09417 244 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 FDXRP22570 491 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CD96P40200 585 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 UBXN1Q04323 297 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 MYO1EQ12965 1108 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RTP5Q14D33 572 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 NAA35Q5VZE5 725 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 OTOP2Q7RTS6 562 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CLEC14AQ86T13 490 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CHST13Q8NET6 341 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SCFD2Q8WU76 684 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 VPS33AQ96AX1 596 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ABHD1Q96SE0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PIP5K1AQ99755 562 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 DLL4Q9NR61 685 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RASAL2Q9UJF2 1139 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 KNSTRNQ9Y448 316 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ARHGEF11O15085 1522 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZMYM3Q14202 1370 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 EEA1Q15075 1411 aa6.63□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 PIAS2O75928 621 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 ZBTB7AO95365 584 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 AFPP02771 609 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 RARGP13631 454 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SDHBP21912 280 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 HSD17B7P56937 341 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 TFCP2Q12800 502 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 BFSP1Q12934 665 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 E2F5Q15329 346 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 CACHD1Q5VU97 1274 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 GARNL3Q5VVW2 1013 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 LIPMQ5VYY2 423 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.62□□□□□ -1.35
NF1-208ENST00000471572 SLC2A7Q6PXP3 512 aa6.62□□□□□ -1.35
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