RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466606.1

EDEM3-205, Transcript of ER degradation enhancing alpha-mannosidase like protein 3, human

TSL 3

Gene EDEM3, Length 487 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDEM3-205	ENST00000466606	A1BG	P04217	495 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	FGFR2	P21802	821 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	TNFSF4	P23510	183 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	PRKAR1B	P31321	381 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	UQCRC1	P31930	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	PICALM	Q13492	652 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	CCNI	Q14094	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	FAM153C	Q494X1	144 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.98	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	MIA2	Q96PC5	1412 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	FANCA	O15360	1455 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	AP4M1	O00189	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	APOL1	O14791	398 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	THAP12	O43422	761 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	DRD4	P21917	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	ITPKB	P27987	946 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	BCAT1	P54687	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	TPTE	P56180	551 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	INHBE	P58166	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	FAM209B	Q5JX69	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	UROC1	Q96N76	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	LPAR3	Q9UBY5	353 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.97	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		4.96	□□□□□ -1.61
EDEM3-205	ENST00000466606		A0A087WZ62	844 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	AQP7P3	A6NL99	342 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	C1QL1	O75973	258 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ONECUT2	O95948	504 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CTGF	P29279	349 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	PGD	P52209	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	E2F1	Q01094	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606		Q6ZWC4	215 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SRL	Q86TD4	932 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CCDC138	Q96M89	665 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	PRR25	Q96S07	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	HPSE	Q9Y251	543 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	KIF14	Q15058	1648 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606		A0A1W2PPC4	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	RASA4B	C9J798	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	RASA4	O43374	803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	INMT	O95050	263 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	NDST3	O95803	873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ATIC	P31939	592 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	MTHFS	P49914	203 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	GATM	P50440	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	AK2	P54819	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
EDEM3-205	ENST00000466606	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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