RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		18.68	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CACNA1H	O95180	2353 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	LEFTY2	O00292	366 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZBED1	O96006	694 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	RALA	P11233	206 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	RARG	P13631	454 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	UCHL3	P15374	230 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CD72	P21854	359 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PLA2G4A	P47712	749 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TUB	P50607	506 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PTPN5	P54829	565 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SLC7A9	P82251	487 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PRKCQ	Q04759	706 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TCF15	Q12870	199 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SYCP1	Q15431	976 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NMUR1	Q9HB89	426 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CBX8	Q9HC52	389 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ST7	Q9NRC1	585 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	USP3	Q9Y6I4	520 aa		18.67	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TBX18	O95935	607 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	IFNAR2	P48551	515 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PSEN1	P49768	467 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TNK2	Q07912	1038 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZNF77	Q15935	545 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PKDCC	Q504Y2	493 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	RAB41	Q5JT25	222 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PMF1	Q6P1K2	205 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DENND1B	Q6P3S1	775 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NEK11	Q8NG66	645 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	RIN3	Q8TB24	985 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SLC35F5	Q8WV83	523 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NDRG1	Q92597	394 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	EBF3	Q9H4W6	596 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	OSER1	Q9NX31	292 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	COL4A3	Q01955	1670 aa		18.66	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SCAMP3	O14828	347 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	OLFM2	O95897	454 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	IRF1	P10914	325 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	KRT9	P35527	623 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	CLCN5	P51795	746 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	BPIFB4	P59827	614 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	YWHAG	P61981	247 aa	Known RBP eCLIP	18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ZXDB	P98169	803 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	USP4	Q13107	963 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	IQCB1	Q15051	598 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SCD5	Q86SK9	330 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	LUZP1	Q86V48	1076 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	STK33	Q9BYT3	514 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	FOXQ1	Q9C009	403 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		18.65	■□□□□ 0.58
USP19-210	ENST00000465902	ARNTL	O00327	626 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	MDM4	O15151	490 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CAVIN2	O95810	425 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	SERPINC1	P01008	464 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ARSA	P15289	507 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CLCN1	P35523	988 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	STARD6	P59095	220 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	RUNX3	Q13761	415 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	PDGFRL	Q15198	375 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	ZNF852	Q6ZMS4	543 aa		18.64	■□□□□ 0.57
USP19-210	ENST00000465902	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	18.64	■□□□□ 0.57

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