RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465245.1

TRA2B-208, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 3

Gene TRA2B, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-208	ENST00000465245	TNNC2	P02585	160 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GNS	P15586	552 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ANO4	Q32M45	955 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	FBXO32	Q969P5	355 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	C8orf48	Q96LL4	319 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	RAX	Q9Y2V3	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	COCH	O43405	550 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	BMP15	O95972	392 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GAP43	P17677	238 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	CACNA2D1	P54289	1103 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GRIK2	Q13002	908 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SDE2	Q6IQ49	451 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	CHPF	Q8IZ52	775 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GPD1L	Q8N335	351 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	FOXJ1	Q92949	421 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SNX25	Q9H3E2	840 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	CD93	Q9NPY3	652 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	INTS13	Q9NVM9	706 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	HCN2	Q9UL51	889 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SHROOM3	Q8TF72	1996 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	TRIM24	O15164	1050 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	IRF1	P10914	325 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	YWHAQ	P27348	245 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	CASP5	P51878	434 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	WDR45B	Q5MNZ6	344 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	GLRX5	Q86SX6	157 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM25	Q86YD3	366 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	NUP93	Q8N1F7	819 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ACOX2	Q99424	681 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	CD248	Q9HCU0	757 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	STK17A	Q9UEE5	414 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	NME7	Q9Y5B8	376 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM131	Q92545	1883 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	MEI4	A8MW99	385 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	CLDN5	O00501	218 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	MAOB	P27338	520 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	GJB2	P29033	226 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	ALCAM	Q13740	583 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	SURF1	Q15526	300 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	HECTD3	Q5T447	861 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	COL26A1	Q96A83	441 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	NACA2	Q9H009	215 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	RAD54B	Q9Y620	910 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A1B0GTW7	788 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF233	A6NK53	670 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	CBFA2T3	O75081	653 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	TACC1	O75410	805 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	ZIC2	O95409	532 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TRA2B-208	ENST00000465245	IDE	P14735	1019 aa		12.76	□□□□□ -0.37

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