RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464454.1

CLK1-208, Transcript of CDC like kinase 1, human

TSL 2

Gene CLK1, Length 484 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLK1-208	ENST00000464454	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	R3HDM4	Q96D70	268 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SNX27	Q96L92	541 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	KLK15	Q9H2R5	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454		M0R3H8	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NPS	P0C0P6	89 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FAM163B	P0C2L3	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CYP2C18	P33260	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ELF2	Q15723	593 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CEP85	Q6P2H3	762 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ARHGEF25	Q86VW2	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	MUL1	Q969V5	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GDF15	Q99988	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	C17orf80	Q9BSJ5	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ASB6	Q9NWX5	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	COX11	Q9Y6N1	276 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454		H0YIZ8	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PODXL	O00592	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	KCNQ3	O43525	872 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NDST3	O95803	873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	C1R	P00736	705 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	JUP	P14923	745 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	UQCRC1	P31930	480 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	HAL	P42357	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PGD	P52209	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ITGA8	P53708	1063 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GGT6	Q6P531	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454		Q6ZWC4	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ZNF384	Q8TF68	577 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	BBC3	Q96PG8	261 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	OVOL3	O00110	214 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SNX2	O60749	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NBN	O60934	754 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	COQ9	O75208	318 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CD19	P15391	556 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ENG	P17813	658 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	ITPKB	P27987	946 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	GABRB3	P28472	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	CHKA	P35790	457 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	BLMH	Q13867	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	DENND2C	Q68D51	928 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CLK1-208	ENST00000464454	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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