RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462694.1

PTEN-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 2

Gene PTEN, Length 383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-202ENST00000462694 COL15A1P39059 1388 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 LGALS16A8MUM7 142 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NPC1O15118 1278 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 RAMP2O60895 175 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 VIPP01282 170 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NR2F6P10588 404 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ADRA1BP35368 520 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 HMGA2P52926 109 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TGFB2P61812 414 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 FOXI1Q12951 378 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PTK2BQ14289 1009 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 CCDC174Q6PII3 467 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 Q6ZPA2 131 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 GATAD2AQ86YP4 633 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 AMER2Q8N7J2 671 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 GRAMD1AQ96CP6 724 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 HERPUD2Q9BSE4 406 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TOR3AQ9H497 397 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 HELLSQ9NRZ9 838 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 IGSF9Q9P2J2 1179 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 DTNAQ9Y4J8 743 aa5.55□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 AQP12BA6NM10 295 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 M0R3H8 397 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 EXOC5O00471 708 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NBNO60934 754 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TJP3O95049 919 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TTLL1O95922 423 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NPPBP16860 134 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TYRP1P17643 537 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PCSK6P29122 969 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 CHKAP35790 457 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PDE1AP54750 535 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ST3GAL2Q16842 350 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 CLEC9AQ6UXN8 241 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 WDR24Q96S15 920 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PCED1AQ9H1Q7 454 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PPCSQ9HAB8 311 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 DACT1Q9NYF0 836 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PACSIN3Q9UKS6 424 aa5.54□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 A8MVJ9 347 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ACKR2O00590 384 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 KIAA0355O15063 1070 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ASNA1O43681 348 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 RHOBTB3O94955 611 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SLPIP03973 132 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ITGA5P08648 1049 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SRGAP2BP0DMP2 458 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NDUFB7P17568 137 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 GKP32189 559 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 HTR7P34969 479 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SERPINF1P36955 418 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 GRK6P43250 576 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 TLDC1Q6P9B6 456 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 ATG16L2Q8NAA4 619 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SUN3Q8TAQ9 357 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 STYXQ8WUJ0 223 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 CCT6BQ92526 530 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 SORCS2Q96PQ0 1159 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 HAPLN3Q96S86 360 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 LRFN1Q9P244 771 aa5.53□□□□□ -1.52
PTEN-202ENST00000462694 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 LINC00473A8K010 186 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 FOXN1O15353 648 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 PMPCBO75439 489 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 WDR47O94967 919 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 NTSR2O95665 410 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 EBLN1P0CF75 366 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 KRT4P19013 534 aa5.52□□□□□ -1.53
PTEN-202ENST00000462694 CTGFP29279 349 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms