RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PRUNE1Q86TP1 453 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC50Q8IVM0 306 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PLD5Q8N7P1 536 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 NAT8LQ8N9F0 302 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TTC13Q8NBP0 860 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BBOF1Q8ND07 529 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZMIZ2Q8NF64 920 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH19Q8TAB3 1148 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CCHCR1Q8TD31 782 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PWWP2AQ96N64 755 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RNF157Q96PX1 679 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 NCAPGQ9BPX3 1015 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM118BQ9BPY3 351 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DUSP16Q9BY84 665 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 B3GNT5Q9BYG0 378 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TSPYL1Q9H0U9 437 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RSAD1Q9HA92 442 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 USP29Q9HBJ7 922 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HESX1Q9UBX0 185 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GINS2Q9Y248 185 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GREB1Q4ZG55 1949 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0U1RQF3 1178 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 A6NNZ2 444 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 A8MXQ7 604 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 I6L893 689 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 M0QZQ0 153 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ALOX15BO15296 676 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 B4GALT3O60512 393 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CST8O60676 142 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ATP2C2O75185 946 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BEST1O76090 585 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FYNP06241 537 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MYZAPP0CAP1 466 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RARBP10826 455 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ETS1P14921 441 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ELNP15502 786 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PAX3P23760 479 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 L1CAMP32004 1257 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RPL9P32969 192 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RPL22P35268 128 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GJC1P36383 396 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 MDH1P40925 334 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CETN2P41208 172 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 ACADSBP45954 432 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RAB27AP51159 221 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CACNA2D1P54289 1103 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GDF10P55107 478 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM189BP81408 668 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CALCOCO2Q13137 446 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SEMA3BQ13214 749 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PDK2Q15119 407 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KCNA10Q16322 511 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UPP1Q16831 310 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 HADHQ16836 314 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SMTNL2Q2TAL5 461 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 P3H1Q32P28 736 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KRT71Q3SY84 523 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TUBB8Q3ZCM7 444 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 BOLA3Q53S33 107 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TJAP1Q5JTD0 557 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KCNT1Q5JUK3 1230 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 WSCD1Q658N2 575 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 DENND2CQ68D51 928 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD16Q68DU8 428 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OR6B2Q6IFH4 312 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FAM171BQ6P995 826 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 FOXR1Q6PIV2 292 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CLEC20AQ6ZU45 233 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 STRADAQ7RTN6 431 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UNC45BQ8IWX7 931 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SCUBE3Q8IX30 993 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SCML4Q8N228 414 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM86AQ8N2M4 240 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 APPL2Q8NEU8 664 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 OR6B3Q8NGW1 331 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 SLC2A14Q8TDB8 520 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRC-210ENST00000462363 CPT1BQ92523 772 aa5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms