RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 TCF3P15923 654 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 AVPR2P30518 371 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 IFNAR2P48551 515 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 RGS7P49802 495 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 BPIFB4P59827 614 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 TPM4P67936 248 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 USP4Q13107 963 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 ULBP1Q9BZM6 244 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 PIAS3Q9Y6X2 628 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa22.53■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 ARNTLO00327 626 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 PGFP49763 221 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 ADIGQ0VDE8 80 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 PDGFRLQ15198 375 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 PMF1Q6P1K2 205 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 TTC8Q8TAM2 541 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 HSFY1Q96LI6 401 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 FAM83CQ9BQN1 747 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 EBF3Q9H4W6 596 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 NMUR1Q9HB89 426 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 ACP6Q9NPH0 428 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 CYLDQ9NQC7 956 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.52■■□□□ 1.2
ABCD4-202ENST00000460308 HELZP42694 1942 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 AOC1P19801 751 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 TNK2Q07912 1038 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 RUNX3Q13761 415 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 UBXN2BQ14CS0 331 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 SYCP1Q15431 976 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 C10orf120Q5SQS8 335 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 TRIM68Q6AZZ1 485 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 SCD5Q86SK9 330 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 NELL2Q99435 816 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 STK33Q9BYT3 514 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 ST7Q9NRC1 585 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 OSER1Q9NX31 292 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CLIC5Q9NZA1 410 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CFAP97Q9P2B7 532 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 SIT1Q9Y3P8 196 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa22.51■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 TBX18O95935 607 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CD72P21854 359 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 KRT9P35527 623 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 KLK7P49862 253 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 ZXDBP98169 803 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA8FQ08AF8 430 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 IQCB1Q15051 598 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 NFKBIBQ15653 356 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 MEA1Q16626 185 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 DENND1BQ6P3S1 775 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 C1orf228Q6PIY5 440 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 FAM71AQ8IYT1 594 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 NEK11Q8NG66 645 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 RIN3Q8TB24 985 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 FAM3CQ92520 227 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 MSANTD3Q96H12 275 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 FOXQ1Q9C009 403 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CBX8Q9HC52 389 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.5■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 F5P12259 2224 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 FAM170BA6NMN3 283 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 PIK3R2O00459 728 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 NCAM2O15394 837 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 CLCN1P35523 988 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 GPD2P43304 727 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 NR1H3Q13133 447 aa22.49■■□□□ 1.19
ABCD4-202ENST00000460308 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.49■■□□□ 1.19
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