RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 ABCG1P45844 678 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ALDH9A1P49189 494 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCT8P50990 548 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PGDP52209 483 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 COPAP53621 1224 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 NXPH1P58417 271 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP1-1Q07627 177 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GPS1Q13098 491 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 BLMHQ13867 455 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF750Q32MQ0 723 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC38Q502W7 563 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FAXCQ5TGI0 409 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FCRL6Q6DN72 434 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PGBD2Q6P3X8 592 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC174Q6PII3 467 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 USP17L6PQ6QN14 398 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 MAVSQ7Z434 540 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GLIS1Q8NBF1 620 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 XAGE5Q8WWM1 108 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ATG4AQ8WYN0 398 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 NELL1Q92832 810 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TRIM63Q969Q1 353 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SARAFQ96BY9 339 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GRAMD1AQ96CP6 724 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 C18orf8Q96DM3 657 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TMEM41AQ96HV5 264 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PBKQ96KB5 322 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TTLL2Q9BWV7 592 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 STK33Q9BYT3 514 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PCDHAC1Q9H158 963 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 AS3MTQ9HBK9 375 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TM7SF3Q9NS93 570 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 RGL1Q9NZL6 768 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 LRFN1Q9P244 771 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 A0A087WZ62 844 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PSMD9O00233 223 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PIP5K1BO14986 540 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TLR5O60602 858 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SNX2O60749 519 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 VNN1O95497 513 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TTLL1O95922 423 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FESP07332 822 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CSF1RP07333 972 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DRD4P21917 467 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GABRB3P28472 473 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 EPHA3P29320 983 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CHKAP35790 457 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 LIPAP38571 399 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 PDE1AP54750 535 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 NPY5RQ15761 445 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 RAB30Q15771 203 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 LY6KQ17RY6 165 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FAM83BQ5T0W9 1011 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TREML2Q5T2D2 321 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SLC9A4Q6AI14 798 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 USP49Q70CQ1 688 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 KRT28Q7Z3Y7 464 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC28AQ8IWP9 274 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 IZUMO1Q8IYV9 350 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 FAM109AQ8N4B1 249 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 MYCT1Q8N699 235 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ANKRD42Q8N9B4 389 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ATG16L2Q8NAA4 619 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCT6BQ92526 530 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DPF1Q92782 380 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 R3HDM4Q96D70 268 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TIMP4Q99727 224 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 C17orf80Q9BSJ5 609 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ALG8Q9BVK2 526 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 EHD3Q9NZN3 535 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 TMOD4Q9NZQ9 345 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DNAJB11Q9UBS4 358 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 DKK4Q9UBT3 224 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 USP22Q9UPT9 525 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 WNT6Q9Y6F9 365 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 A1L4Q6 167 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CCDC151A5D8V7 595 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 WIPF3A6NGB9 483 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRC-208ENST00000427110 CGB1A6NKQ9 187 aa2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms