RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRA2Q96PE1 1338 aa19.08■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PHIPQ8WWQ0 1821 aa19.08■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KLF11O14901 512 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PEX10O60683 326 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 STAM2O75886 525 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 BAG2O95816 211 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CDC16Q13042 620 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PTPN20Q4JDL3 420 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 MDH1BQ5I0G3 518 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 EMC1Q8N766 993 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PPP2R3CQ969Q6 453 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 NDNQ99608 321 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPKQ9BS16 269 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 THTPAQ9BU02 230 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PORCNQ9H237 461 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PCSK1NQ9UHG2 260 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 USP2O75604 605 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PIGRP01833 764 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KDELR1P24390 212 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TAF5Q15542 800 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 GPAMQ9HCL2 828 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC7A8Q9UHI5 535 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TAGLN3Q9UI15 199 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PPM1HQ9ULR3 514 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SBF1O95248 1867 aa19.07■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KBTBD13C9JR72 458 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 MAFGO15525 162 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 USP1O94782 785 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT3P12035 628 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TSHRP16473 764 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ABCD1P33897 745 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 NAMPTP43490 491 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TAP1Q03518 808 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TMEM132BQ14DG7 1078 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM81AQ8TBF8 368 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CYTH4Q9UIA0 394 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 IKBKGQ9Y6K9 419 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 IRF6O14896 467 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 AVILO75366 819 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 FAM155BO75949 473 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KDSRQ06136 332 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TMCO4Q5TGY1 634 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 XRRA1Q6P2D8 792 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DENND1BQ6P3S1 775 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB33Q86T24 672 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 TTC13Q8NBP0 860 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC44A1Q8WWI5 657 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SPON1Q9HCB6 807 aa19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ADM5C9JUS6 153 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PDLIM1O00151 329 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 BUD23O43709 281 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 INHBAP08476 426 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SP2Q02086 613 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DNAL1Q4LDG9 190 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 C1orf146Q5VVC0 180 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 RFX6Q8HWS3 928 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 C12orf42Q96LP6 360 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 NIF3L1Q9GZT8 377 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 EBF3Q9H4W6 596 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 EFR3BQ9Y2G0 817 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT7P08729 469 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 RBP3P10745 1247 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DPYSL3Q14195 570 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 RAPH1Q70E73 1250 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 HAPLN3Q96S86 360 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 MECRQ9BV79 373 aa19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 DCAF8L1A6NGE4 600 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 I3L4J1 428 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PYGLP06737 847 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 KCTD6Q8NC69 237 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA18Q8TC71 538 aa19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
RALGPS1-208ENST00000424082 HSPH1Q92598 858 aa19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms