RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIPC2Q8TF65 315 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC22A17Q8WUG5 538 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 OVCA2Q8WZ82 227 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYRFLQ96LU7 910 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLITRK1Q96PX8 696 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TLE6Q9H808 572 aa17.76■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 C2CD4BA6NLJ0 364 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PROSCO94903 275 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDGFRAP16234 1089 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GPD1P21695 349 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXA9P31269 272 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAN1A1P33908 653 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MATKP42679 507 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC1A1P43005 524 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP46P62068 366 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MESDQ14696 234 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 BHLHA9Q7RTU4 235 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLFN11Q7Z7L1 901 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ELMOD1Q8N336 334 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 EMC1Q8N766 993 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PDZD8Q8NEN9 1154 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO32Q969P5 355 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMG2Q969U7 264 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC2A13Q96QE2 648 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CNPY3Q9BT09 278 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM7Q9C029 511 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCC13Q9NSE7 274 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRN3Q9NYV6 651 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMCD1Q9NZU5 365 aa17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DPYSL4O14531 572 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CAPN9O14815 690 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GRAP2O75791 330 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMYND10O75800 440 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SDC4P31431 198 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NOS2P35228 1153 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 FLT3P36888 993 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTPN9P43378 593 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MTMR3Q13615 1198 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DUSP6Q16828 381 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPM1LQ5SGD2 360 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 BSPRYQ5W0U4 402 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RXFP2Q8WXD0 754 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD6Q96KE9 485 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCAPGQ9BPX3 1015 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAN1C1Q9NR34 630 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 STAP1Q9ULZ2 295 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 JRKLQ9Y4A0 524 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa17.74■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PER2O15055 1255 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSMA2P25787 234 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPP3CCP48454 512 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 OGDHQ02218 1023 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAF10Q12962 218 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD8Q5XKL5 378 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DEFB106AQ8N104 65 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC35F6Q8N357 371 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 STKLD1Q8NE28 680 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 CLIC5Q9NZA1 410 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ALG6Q9Y672 507 aa17.73■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NLRC5Q86WI3 1866 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RFXAPO00287 272 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF8O76064 485 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 POU2F2P09086 479 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NCAM1P13591 858 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPCAMP16422 314 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRIP1P48552 1158 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A52Q3SY17 297 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 DCAF6Q58WW2 860 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 HFE2Q6ZVN8 426 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 PEX26Q7Z412 305 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 SCD5Q86SK9 330 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 NT5C3BQ969T7 300 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM51Q9NW97 253 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 GMIPQ9P107 970 aa17.72■□□□□ 0.43
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQH9 124 aa17.71■□□□□ 0.43
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