RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418674.1

PTPRC-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-207ENST00000418674 ACKR2O00590 384 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SOAT2O75908 522 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ITGA5P08648 1049 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TPH1P17752 444 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 EGR1P18146 543 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 LRPAP1P30533 357 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CCT5P48643 541 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 NDUFV1P49821 464 aa3.41□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 LILRA4P59901 499 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SPARCL1Q14515 664 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ZNF750Q32MQ0 723 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 FAM153CQ494X1 144 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
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PTPRC-207ENST00000418674 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 SARAFQ96BY9 339 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 OSBPL9Q96SU4 736 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 ALG8Q9BVK2 526 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 TPSD1Q9BZJ3 242 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 MAGEH1Q9H213 219 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 KLC4Q9NSK0 619 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DACT1Q9NYF0 836 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 IGSF9Q9P2J2 1179 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-207ENST00000418674 AQP7P3A6NL99 342 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LINC00473A8K010 186 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PIP5K1BO14986 540 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 NPHP1O15259 732 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TTLL1O95922 423 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 HSD3B1P14060 373 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 IDEP14735 1019 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ITGALP20701 1170 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 KCNA3P22001 575 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PXNP49023 591 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 DGKEP52429 567 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ITGA8P53708 1063 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 KRT17Q04695 432 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PPFIA1Q13136 1202 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 BIRC3Q13489 604 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 KCNAB1Q14722 419 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MAPKAPK3Q16644 382 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 LAYNQ6UX15 382 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TMEM108Q6UXF1 575 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 BPIFB1Q8TDL5 484 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 TBC1D20Q96BZ9 403 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 EID2BQ96D98 161 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 SAGE1Q9NXZ1 904 aa3.4□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ADGRA2Q96PE1 1338 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 WDR27A2RRH5 827 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 M0R3H8 397 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRC-207ENST00000418674 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ATICP31939 592 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SATB1Q01826 763 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 POU5F1BQ06416 359 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 MYO1EQ12965 1108 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 POSTNQ15063 836 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 SLC5A9Q2M3M2 681 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 PLAC9Q5JTB6 97 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-207ENST00000418674 TMTC4Q5T4D3 741 aa3.39□□□□□ -1.87
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