RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CTHP32929 405 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NBL1P41271 181 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MAGEA9P43362 315 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PSEN1P49768 467 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PDE4CQ08493 712 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FZD5Q13467 585 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RUNX3Q13761 415 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CNGA2Q16280 664 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TCP11X2Q5H9J9 407 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ERMP1Q7Z2K6 904 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF276Q8N554 614 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM3CQ92520 227 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZSWIM1Q9BR11 485 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CCSER2Q9H7U1 834 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CYLDQ9NQC7 956 aa18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.61■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCAM2O15394 837 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TLR5O60602 858 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLA2G4AP47712 749 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SOX9P48436 509 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IFNAR2P48551 515 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MFAP3P55082 362 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRIM68Q6AZZ1 485 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EBF3Q9H4W6 596 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NMUR1Q9HB89 426 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SIX2Q9NPC8 291 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OSER1Q9NX31 292 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.6■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TULP2O00295 520 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARSAP15289 507 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RPS9P46781 194 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EML3Q32P44 896 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GJB7Q6PEY0 223 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TXNDC11Q6PKC3 985 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCD5Q86SK9 330 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCTD13Q8WZ19 329 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATP2A3Q93084 1043 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SMPD4Q9NXE4 827 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WNT6Q9Y6F9 365 aa18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A0A1W2PQH9 124 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRT5P13647 590 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TKTL1P51854 596 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYL5Q02045 173 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 APBA1Q02410 837 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TYRO3Q06418 890 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MEA1Q16626 185 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CPA6Q8N4T0 437 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TTC8Q8TAM2 541 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UBA3Q8TBC4 463 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC35F5Q8WV83 523 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SHC3Q92529 594 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHFRQ96EP1 664 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ECT2Q9H8V3 914 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFAP97Q9P2B7 532 aa18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 E2F8A0AVK6 867 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 BECN2A8MW95 431 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CALCAP01258 141 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHRNB1P11230 501 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RARGP13631 454 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ID4P47928 161 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 AMPD2Q01433 879 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KCNMA1Q12791 1236 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCML4Q8N228 414 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGAP18Q8N392 663 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TTC16Q8NEE8 873 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LINC00597Q9H2U6 94 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LRRC4Q9HBW1 653 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FANCLQ9NW38 375 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NAGPAQ9UK23 515 aa18.57■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 M0QYV0 167 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NFATC1O95644 943 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TBX18O95935 607 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZBED1O96006 694 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GJA4P35212 333 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCAPHQ15003 741 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KRT31Q15323 416 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGAP44Q17R89 818 aa18.56■□□□□ 0.56
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.5 ms