RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC28BQ9BUN5 200 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FUT8Q9BYC5 575 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM192AQ9GZU8 254 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCB6Q9NP58 842 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATPIF1Q9UII2 106 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SPATA2Q9UM82 520 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.58□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC162PA2VCL2 907 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PODXLO00592 558 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AP1G2O75843 785 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PGM3O95394 542 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PRR29P0C7W0 189 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FOSL2P15408 326 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CD52P31358 61 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PGM1P36871 562 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FLT3P36888 993 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TUFMP49411 452 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RGS7P49802 495 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GPC5P78333 572 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HTRA3P83110 453 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TAP1Q03518 808 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF235Q14590 738 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 INPP5AQ14642 412 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SEZ6Q53EL9 994 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXO47Q5MNV8 452 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 WLSQ5T9L3 541 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NAA35Q5VZE5 725 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZPBP2Q6X784 338 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXL16Q8N461 479 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF555Q8NEP9 628 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SKA1Q96BD8 255 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HINFPQ9BQA5 517 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BBS2Q9BXC9 721 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RNPEPQ9H4A4 650 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ASB7Q9H672 318 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RIPK3Q9Y572 518 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATRNL1Q5VV63 1379 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CFAP99D6REC4 459 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R37O75864 691 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PRLP01236 227 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADH1AP07327 375 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MMP3P08254 477 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KRT16P08779 473 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 WEE2P0C1S8 567 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC9A1P19634 815 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ACO1P21399 889 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AKAP5P24588 427 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC11A2P49281 568 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FMO5P49326 533 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ARFIP2P53365 341 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADARP55265 1226 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SOX10P56693 466 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PPP2R2AP63151 447 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TLE2Q04725 743 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADCY1Q08828 1119 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RBL2Q08999 1139 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 STK4Q13043 487 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GRB10Q13322 594 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MTHFD1LQ6UB35 978 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HEATR4Q86WZ0 1026 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CHSY1Q86X52 802 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GATAD2AQ86YP4 633 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KSR1Q8IVT5 923 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SPIRE2Q8WWL2 714 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 IFT43Q96FT9 208 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PANX2Q96RD6 677 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GAD1Q99259 594 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 DESI2Q9BSY9 194 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP44Q9C0F1 390 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SENP1Q9P0U3 644 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 KIAA1257Q9ULG3 409 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 UMODL1Q5DID0 1318 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms