RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 HVCN1Q96D96 273 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 OTUB2Q96DC9 234 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 TOR4AQ9NXH8 423 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 RAD54BQ9Y620 910 aa20.53■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 COCHO43405 550 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 CYP4F3Q08477 520 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 NUDT18Q6ZVK8 323 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 DYMQ7RTS9 669 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 CHPFQ8IZ52 775 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 HPDLQ96IR7 371 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa20.52■□□□□ 0.88
HOXD12-201ENST00000404162 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GRIN1Q05586 938 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 SDE2Q6IQ49 451 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 OR5B17Q8NGF7 314 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 FOXJ1Q92949 421 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PCIF1Q9H4Z3 704 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PTPRJQ12913 1337 aa20.51■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GTW7 788 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PRRT4C9JH25 899 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MYO1EQ12965 1108 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ACCSQ96QU6 501 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GABRG3Q99928 467 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CBWD1Q9BRT8 395 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.5■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 A0A087WV48 116 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 WASH3PC4AMC7 463 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 DKK1O94907 266 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GARTP22102 1010 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 YWHAQP27348 245 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 DDIT3P35638 169 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 BNC1Q01954 994 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf57Q0VDD7 668 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CAMK2BQ13554 666 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MMS19Q96T76 1030 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GAREM1Q9H706 876 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 TM7SF3Q9NS93 570 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 INTS13Q9NVM9 706 aa20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CLDN5O00501 218 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 IRF1P10914 325 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CD6P30203 668 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 NUP93Q8N1F7 819 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO32Q969P5 355 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 TRIM9Q9C026 710 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 DPEP3Q9H4B8 488 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 MEI4A8MW99 385 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CILPO75339 1184 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 C1QL1O75973 258 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF883P0CG24 379 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 CASP5P51878 434 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 HECTD3Q5T447 861 aa20.47■□□□□ 0.87
HOXD12-201ENST00000404162 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms