RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399977.8

BIN3-202, Transcript of bridging integrator 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene BIN3, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3-202ENST00000399977 RBSNQ9H1K0 784 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 CCSER2Q9H7U1 834 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 NMUR1Q9HB89 426 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 OSER1Q9NX31 292 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 OBP2AQ9NY56 170 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 CCL26Q9Y258 94 aa14.66□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 TRIOO75962 3097 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 COCHO43405 550 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 TLR5O60602 858 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 FBXO21O94952 628 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 TBX18O95935 607 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 MMEP08473 750 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 CCDC172P0C7W6 258 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 SRFP11831 508 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 RARGP13631 454 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 PBX1P40424 430 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 GAS2L3Q86XJ1 694 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 TMEM35BQ8NCS4 154 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 BPIFB1Q8TDL5 484 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 BAP1Q92560 729 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 EDAQ92838 391 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 LRRC3BQ96PB8 259 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 NOX5Q96PH1 765 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 BRD9Q9H8M2 597 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 SMPD4Q9NXE4 827 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 CYTH4Q9UIA0 394 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 NUDT5Q9UKK9 219 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 MYO6Q9UM54 1294 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.65□□□□□ -0.06
BIN3-202ENST00000399977 ZNF263O14978 683 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 FERP16591 822 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 GDI1P31150 447 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SNX16P57768 344 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SLC7A9P82251 487 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 PDCLQ13371 301 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 C10orf120Q5SQS8 335 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 BTBD8Q5XKL5 378 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 TMEM110Q86TL2 294 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 ZNF677Q86XU0 584 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 FMNL3Q8IVF7 1028 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SCML4Q8N228 414 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 EPHX3Q9H6B9 360 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SYNCQ9H7C4 482 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CYLDQ9NQC7 956 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CPQQ9Y646 472 aa14.64□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 LRRC53A6NM62 1247 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 YJEFN3A6XGL0 299 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 E5RJQ4 531 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 E7ENQ6 273 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 LEFTY2O00292 366 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 OLFM2O95897 454 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 DAOAP59103 153 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CDR2Q01850 454 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 FIGNQ5HY92 759 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 ZNF276Q8N554 614 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 RNF139Q8WU17 664 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 IRGQQ8WZA9 623 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 GOLGA1Q92805 767 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 IRF7Q92985 503 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CPXM1Q96SM3 734 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 TRIM5Q9C035 493 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 GKN1Q9NS71 199 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP14.63□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 FAM170AA1A519 330 aa14.62□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 CHADO15335 359 aa14.62□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
BIN3-202ENST00000399977 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms