RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM62Q9BVG3 475 aa16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACP6Q9NPH0 428 aa16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNT16Q9UBV4 365 aa16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRWD1Q9NSI6 2320 aa16.08■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF263O14978 683 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHADO15335 359 aa16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADIGQ0VDE8 80 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP4Q13107 963 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDCLQ13371 301 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM110Q86TL2 294 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EFCAB3Q8N7B9 438 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC22A12Q96S37 553 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CYP2S1Q96SQ9 504 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ULBP1Q9BZM6 244 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NACA2Q9H009 215 aa16.07■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDCL3Q9H2J4 239 aa16.07■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PQJ5 194 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GFPT2O94808 682 aa16.06■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FERP16591 822 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PBX1P40424 430 aa16.06■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP16.06■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCD5Q86SK9 330 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF214Q8ND24 703 aa16.06■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOLGA1Q92805 767 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RSPRY1Q96DX4 576 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSANTD3Q96H12 275 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MIS12Q9H081 205 aa16.06■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF38Q9H0F5 515 aa16.06■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BRD9Q9H8M2 597 aa16.06■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ITIH6Q6UXX5 1313 aa16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCP1P13796 627 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RGS7P49802 495 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTF1Q14872 753 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PDGFRLQ15198 375 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF77Q15935 545 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BEND5Q7L4P6 421 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BHLHA9Q7RTU4 235 aa16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 BAP1Q92560 729 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTYH3Q9C0H2 523 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSER1Q9NX31 292 aa16.05■□□□□ 0.16
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXL21Q9UKT6 434 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCL26Q9Y258 94 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CPQQ9Y646 472 aa16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARNTLO00327 626 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CFHP08603 1231 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GLULP15104 373 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GDI1P31150 447 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRKCQQ04759 706 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRM2Q14416 872 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTBD8Q5XKL5 378 aa16.04■□□□□ 0.16
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf228Q6PIY5 440 aa16.04■□□□□ 0.16
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