RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364234.1

RNU6-11P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 11, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-11P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-11P-201ENST00000364234 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 TLDC1Q6P9B6 456 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 KIAA0408Q6ZU52 694 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 SFTPA1Q8IWL2 248 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 SYTL1Q8IYJ3 562 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 GPR150Q8NGU9 434 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM41AQ96HV5 264 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 VPS50Q96JG6 964 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 GDF15Q99988 308 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM8AQ9HCN3 771 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 SNX15Q9NRS6 342 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 RGL1Q9NZL6 768 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 AMFRQ9UKV5 643 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 WNT6Q9Y6F9 365 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-11P-201ENST00000364234 H0YIZ8 118 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 EXOC5O00471 708 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMPRSS11DO60235 418 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 GLP2RO95838 553 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 NUDT3O95989 172 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 JUPP14923 745 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CREB1P16220 341 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 DRD4P21917 467 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 BMP5P22003 454 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 GABRB3P28472 473 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 PCSK6P29122 969 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 PPM1AP35813 382 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 HSPA7P48741 367 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 DGKQP52824 942 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 RHBDL3P58872 404 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 KCNAB1Q14722 419 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 MPEG1Q2M385 716 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 PCID2Q5JVF3 399 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SUMO4Q6EEV6 95 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 PGBD2Q6P3X8 592 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CRTC1Q6UUV9 634 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 TTC30AQ86WT1 665 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SARAFQ96BY9 339 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZG16BQ96DA0 208 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLC39A13Q96H72 371 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 STK33Q9BYT3 514 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 PCDHAC1Q9H158 963 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CPNE5Q9HCH3 593 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 RXFP3Q9NSD7 469 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLC52A1Q9NWF4 448 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 VPS51Q9UID3 782 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 COMMD10Q9Y6G5 202 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 A0A087WZ62 844 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 OR2W5A6NFC9 320 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 H7C1Q1 480 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CES2O00748 559 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 MGST3O14880 152 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 FFAR2O15552 330 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 VIPP01282 170 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 FGAP02671 866 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ERBB2P04626 1255 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ELFN1P0C7U0 828 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 TMEM225BP0DP42 221 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ENGP17813 658 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ABCB4P21439 1286 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ITPKBP27987 946 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CTGFP29279 349 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 E2F1Q01094 437 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 GPS1Q13098 491 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ATP1A4Q13733 1029 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 STARD3Q14849 445 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 KRT72Q14CN4 511 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 ACOX1Q15067 660 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CYP1B1Q16678 543 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 CLEC9AQ6UXN8 241 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 USP49Q70CQ1 688 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SKAP1Q86WV1 359 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 GLIS1Q8NBF1 620 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-11P-201ENST00000364234 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.26□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms