RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 KCNH6Q9H252 994 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 LINC00597Q9H2U6 94 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ACP6Q9NPH0 428 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 FANCLQ9NW38 375 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 HESX1Q9UBX0 185 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NUDT5Q9UKK9 219 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 M0QYV0 167 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MAN2B1O00754 1011 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MDM4O15151 490 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2G4AP47712 749 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 IFNAR2P48551 515 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 TKTL1P51854 596 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MFAP3P55082 362 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PDGFRLQ15198 375 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KRT31Q15323 416 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 BHLHA9Q7RTU4 235 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 OSBPL6Q9BZF3 934 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ULBP1Q9BZM6 244 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 UBXN6Q9BZV1 441 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CYLDQ9NQC7 956 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP97Q9P2B7 532 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NAGPAQ9UK23 515 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 KIAA1257Q9ULG3 409 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 GABBR2O75899 941 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SETSIPP0DME0 302 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 IRF1P10914 325 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 RARGP13631 454 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 RGS7P49802 495 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NUBP1P53384 320 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SLC8A3P57103 927 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MYL5Q02045 173 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ADIGQ0VDE8 80 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NCAPHQ15003 741 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 PON2Q15165 354 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 CNGA2Q16280 664 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MSANTD3Q96H12 275 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ECT2Q9H8V3 914 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC12Q9UKB3 198 aa15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG1-201ENST00000361211 H0Y858 1186 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3R2O00459 728 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 ZBED1O96006 694 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 PTPN5P54829 565 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 STILQ15468 1287 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 PMF1Q6P1K2 205 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 AOPEPQ8N6M6 819 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 SLC35F5Q8WV83 523 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 SHC3Q92529 594 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 CLDN23Q96B33 292 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 PRRX2Q99811 253 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 VPS16Q9H269 839 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 LRRC4Q9HBW1 653 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 FHOD1Q9Y613 1164 aa15.7■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 GREM1O60565 184 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 CHRNB1P11230 501 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 LCP1P13796 627 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 GNA15P30679 374 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 GJA4P35212 333 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 USP8P40818 1118 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 KLK7P49862 253 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 NHLH1Q02575 133 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 ANGPT1Q15389 498 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 GAB4Q2WGN9 574 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 DENND1BQ6P3S1 775 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 CPA6Q8N4T0 437 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 KCTD13Q8WZ19 329 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 ATP2A3Q93084 1043 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 FAM81BQ96LP2 452 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 NELL2Q99435 816 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 NACA2Q9H009 215 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 FAM86C1Q9NVL1 165 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 CACNA1HO95180 2353 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 THAP12O43422 761 aa15.68■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 NFATC1O95644 943 aa15.68■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 CYP17A1P05093 508 aa15.68■□□□□ 0.1
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF18P17022 549 aa15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms