RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349157.10

PUF60-202, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PUF60, Length 1,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-202ENST00000349157 CD52P31358 61 aa20.37■□□□□ 0.85
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PUF60-202ENST00000349157 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
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PUF60-202ENST00000349157 YY1P25490 414 aa20.33■□□□□ 0.85
PUF60-202ENST00000349157 ARL4CP56559 192 aa20.33■□□□□ 0.85
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PUF60-202ENST00000349157 TAF5Q15542 800 aa20.33■□□□□ 0.85
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