RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CEP112Q8N8E3 955 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 COG1Q8WTW3 980 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 STK32AQ8WU08 396 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 TOP1MTQ969P6 601 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MIS12Q9H081 205 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CWH43Q9H720 699 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MARCH5Q9NX47 278 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 VWA8A3KMH1 1905 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 MYBPHLA2RUH7 354 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 BAIAP3O94812 1187 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 SNX16P57768 344 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 PPP4R4Q6NUP7 873 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 FAM171BQ6P995 826 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 RELL1Q8IUW5 271 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CD101Q93033 1021 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PKMYT1Q99640 499 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 CYLDQ9NQC7 956 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 PTPRDP23468 1912 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 BCAR1P56945 870 aa6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 CREG2Q8IUH2 290 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
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CCR6-201ENST00000341935 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa6.34□□□□□ -1.39
CCR6-201ENST00000341935 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.34□□□□□ -1.4
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CCR6-201ENST00000341935 BEST1O76090 585 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OAZ2O95190 189 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NPR3P17342 541 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ACADSBP45954 432 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC8A3P57103 927 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
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CCR6-201ENST00000341935 CLEC20AQ6ZU45 233 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 UBL4BQ8N7F7 174 aa6.34□□□□□ -1.4
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CCR6-201ENST00000341935 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6.34□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
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CCR6-201ENST00000341935 DESP17661 470 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FGFR3P22607 806 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PBX3P40426 434 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCNN1BP51168 640 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MAP3K7CLP57077 242 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TBX4P57082 545 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OGDHQ02218 1023 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM171A1Q5VUB5 890 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C16orf59Q7L2K0 433 aa6.33□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.33□□□□□ -1.4
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