RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340157.8

VRK2-201, Transcript of vaccinia related kinase 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VRK2, Length 1,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK2-201ENST00000340157 ECHS1P30084 290 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 MATKP42679 507 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 FNTAP49354 379 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 ARSEP51690 589 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 FUT10Q6P4F1 479 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 MAIP1Q8WWC4 291 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 HSPH1Q92598 858 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 FAM149B1Q96BN6 582 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 SLC2A13Q96QE2 648 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 TBCBQ99426 244 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 FAM118BQ9BPY3 351 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.17■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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VRK2-201ENST00000340157 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.16■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 CWH43Q9H720 699 aa22.16■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.16■■□□□ 1.14
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VRK2-201ENST00000340157 USP17L7P0C7H9 530 aa22.15■■□□□ 1.14
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VRK2-201ENST00000340157 SYPL2Q5VXT5 272 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 BNIPLQ7Z465 357 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 CEP57Q86XR8 500 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 IFT81Q8WYA0 676 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 NT5C3BQ969T7 300 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 NFU1Q9UMS0 254 aa22.15■■□□□ 1.14
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VRK2-201ENST00000340157 FAM187AA6NFU0 413 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 EFEMP2O95967 443 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 DEFB103AP81534 67 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 TAS1R1Q7RTX1 841 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa22.15■■□□□ 1.14
VRK2-201ENST00000340157 TJP3O95049 919 aa22.14■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 CETN2P41208 172 aa22.14■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 CA9Q16790 459 aa22.14■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 SLC25A52Q3SY17 297 aa22.14■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 RTP2Q5QGT7 225 aa22.14■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 DUPD1Q68J44 220 aa22.14■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 SCYL2Q6P3W7 929 aa22.14■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 C4orf50Q6ZRC1 276 aa22.14■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 NPY6RQ99463 290 aa22.14■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 PNPLA8Q9NP80 782 aa22.14■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 CCNG2Q16589 344 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 ODF2Q5BJF6 829 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 POPDC2Q9HBU9 364 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 USP3Q9Y6I4 520 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 FAM153BP0C7A2 387 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 NOS2P35228 1153 aa22.13■■□□□ 1.13
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VRK2-201ENST00000340157 STRADAQ7RTN6 431 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 VN1R3Q9BXE9 311 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 TRIM31Q9BZY9 425 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 DPH5Q9H2P9 285 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
VRK2-201ENST00000340157 KIAA1671Q9BY89 1806 aa22.12■■□□□ 1.13
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