RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 SGK1O00141 431 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 AP1G2O75843 785 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 ITGB1P05556 798 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 ODC1P11926 461 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 DESP17661 470 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 IL4RP24394 825 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 YY1P25490 414 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 CACNA2D1P54289 1103 aa18.68■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 SLC29A2Q14542 456 aa18.68■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa18.68■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 KCNK16Q96T55 309 aa18.68■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.583e-14■■■□□ 15
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ACTB-201ENST00000331789 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa18.67■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 KBTBD13C9JR72 458 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 CLLU1OSQ5K130 101 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 ERMARDQ5T6L9 678 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 SLC24A5Q71RS6 500 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 UROC1Q96N76 676 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 RIPK2O43353 540 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 NUDT17P0C025 328 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa18.66■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 C1orf228Q6PIY5 440 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 UNC45BQ8IWX7 931 aa18.66■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 DAB1O75553 588 aa18.65■□□□□ 0.58
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ACTB-201ENST00000331789 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 CCDC185Q8N715 623 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 PQLC3Q8N755 202 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 SPATA18Q8TC71 538 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 MYLPFQ96A32 169 aa18.65■□□□□ 0.58
ACTB-201ENST00000331789 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.65■□□□□ 0.58
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