RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 LTFP02788 710 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDC4P31431 198 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLCN4P51793 760 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX26Q7Z412 305 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP18Q8N392 663 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC57Q8N9N7 239 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC7A14Q8TBB6 771 aa28.74■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FBXO32Q969P5 355 aa28.74■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR24Q96S15 920 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 IL37Q9NZH6 218 aa28.74■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPP7Q9UHL4 492 aa28.74■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DAB1O75553 588 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 FTCDO95954 541 aa28.73■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC1A1P43005 524 aa28.73■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP2R3CQ969Q6 453 aa28.73■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CNPY3Q9BT09 278 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 GOLPH3Q9H4A6 298 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLE6Q9H808 572 aa28.73■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 EPOPA6NHQ4 379 aa28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP28.72■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RTL10Q7L3V2 364 aa28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa28.72■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF8O76064 485 aa28.71■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB106AQ8N104 65 aa28.71■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF576Q9H609 170 aa28.71■■■□□ 2.19
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CTDNEP1-201ENST00000318988 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PTPN9P43378 593 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC14Q49A88 953 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 MEI1Q5TIA1 1274 aa28.69■■■□□ 2.18
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
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