RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301886.3

ARL2-SNX15-201, Transcript of ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ARL2-SNX15, Length 2,392 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 THAP1Q9NVV9 213 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF180Q9UJW8 692 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBX20Q9UMR3 447 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CRTAMO95727 393 aa23.57■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa23.57■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RIT2Q99578 217 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C10orf88Q9H8K7 445 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa23.57■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa23.57■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TEX264Q9Y6I9 313 aa23.57■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BPGMP07738 259 aa23.56■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 WDR44Q5JSH3 913 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TMEM126BQ8IUX1 230 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FBXW8Q8N3Y1 598 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POU5F2Q8N7G0 328 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HIPK4Q8NE63 616 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 USP6NLQ92738 828 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYB561D2O14569 222 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 POLR2MP0CAP2 368 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 YY1P25490 414 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AP4B1Q9Y6B7 739 aa23.56■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM189A1O60320 539 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C1QAP02745 245 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GNA15P30679 374 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CNGA3Q16281 694 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MAP4K3Q8IVH8 894 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 RFPL1O75677 317 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PORP16435 677 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACO1P21399 889 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HDAC4P56524 1084 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF2IP78347 998 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BASP1P80723 227 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 COG7P83436 770 aa23.55■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TICAM1Q8IUC6 712 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SLC13A1Q9BZW2 595 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa23.55■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.55■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SRGAP2BP0DMP2 458 aa23.54■■□□□ 1.36
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ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DYNLT1P63172 113 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 HPS6Q86YV9 775 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PPM1NQ8N819 430 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MMP8P22894 467 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 MTTPP55157 894 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 DEFB107AQ8IZN7 70 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CATSPER1Q8NEC5 780 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CMTM5Q96DZ9 223 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 BIRC8Q96P09 236 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 APOL6Q9BWW8 343 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CYP4F11Q9HBI6 524 aa23.54■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.53■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 FAM58BPP0C7Q3 252 aa23.53■■□□□ 1.36
ARL2-SNX15-201ENST00000301886 CBLBQ13191 982 aa23.53■■□□□ 1.36
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