RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 PMF1Q6P1K2 205 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 UNC5BQ8IZJ1 945 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CFAP61Q8NHU2 1237 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 PGLYRP2Q96PD5 576 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CNPY3Q9BT09 278 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 FOXP3Q9BZS1 431 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SENP1Q9P0U3 644 aa13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 USP12O75317 370 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 AMPD1P23109 780 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 GTF2A2P52657 109 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CLDN10P78369 228 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 GBE1Q04446 702 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 LGSNQ5TDP6 509 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC134Q9H6E4 229 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ACSS2Q9NR19 701 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 WDR35Q9P2L0 1181 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CAPN9O14815 690 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 FGFR1P11362 822 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SLC10A6Q3KNW5 377 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 LRRC38Q5VT99 294 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TTC16Q8NEE8 873 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 APOL2Q9BQE5 337 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CACNG4Q9UBN1 327 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SLC24A2Q9UI40 661 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TGFB3P10600 412 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 GHRHRQ02643 423 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 EML3Q32P44 896 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 FAM161BQ96MY7 647 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 VPS11Q9H270 941 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SNX25Q9H3E2 840 aa13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ZWINTO95229 277 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ATG7O95352 703 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 PIGRP01833 764 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 VDRP11473 427 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ICAM3P32942 547 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF132P52740 706 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC142Q17RM4 750 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 DCAF6Q58WW2 860 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ARMCX2Q7L311 632 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 OPTNQ96CV9 577 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 H3BRJ5 948 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 LGALS2P05162 132 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 GMPRP36959 345 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 NBPF20Q3BBV1 942 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 PYROXD2Q8N2H3 581 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 DNAAF3Q8N9W5 541 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ACSS3Q9H6R3 686 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 DOCK5Q9H7D0 1870 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 H3BRB1 525 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 IL18RAPO95256 599 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ABHD2P08910 425 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 LRRC36Q1X8D7 754 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 KDELC2Q7Z4H8 507 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 RSPH3Q86UC2 560 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SLC25A41Q8N5S1 370 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 RNF34Q969K3 372 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 C12orf42Q96LP6 360 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CYP4F11Q9HBI6 524 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 C15orf41Q9Y2V0 281 aa13.48□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CCND1P24385 295 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 CYP2F1P24903 491 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 GPD2P43304 727 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 NAT8LQ8N9F0 302 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 SLC16A10Q8TF71 515 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 USP6NLQ92738 828 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 ARL8BQ9NVJ2 186 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 STARD13Q9Y3M8 1113 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
LRTM2-201ENST00000299194 BRWD3Q6RI45 1802 aa13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms