RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298307.9

KLHDC2-201, Transcript of kelch domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLHDC2, Length 5,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2-201ENST00000298307 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NCANO14594 1321 aa20.49■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 IL18RAPO95256 599 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ATP6V1E1P36543 226 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 BNIP1Q12981 228 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 MMRN1Q13201 1228 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC126Q96EE4 140 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 KCTD10Q9H3F6 313 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NR5A2O00482 541 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 SPATA33Q96N06 139 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 KLRK1P26718 216 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CYP24A1Q07973 514 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 BTBD8Q5XKL5 378 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 PDGFRBP09619 1106 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TRIM54Q9BYV2 358 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 RRN3Q9NYV6 651 aa20.48■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 C2CD2LO14523 706 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 LSM8O95777 96 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ABHD2P08910 425 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NFYCQ13952 458 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 IL17AQ16552 155 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CBWD6Q4V339 395 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 DCAF6Q58WW2 860 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CD274Q9NZQ7 290 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 UBDO15205 165 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 RASSF9O75901 435 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NR3C2P08235 984 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 MGAT5Q09328 741 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 STKLD1Q8NE28 680 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 SPON2Q9BUD6 331 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CYP4F12Q9HCS2 524 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NPTX2P47972 431 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 LINC00523Q86TU6 105 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 EMC1Q8N766 993 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 RGS5O15539 181 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NR1H2P55055 460 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 GTF2H3Q13889 308 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 SEZ6Q53EL9 994 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 DHFR2Q86XF0 187 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 UNC45BQ8IWX7 931 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TRIM62Q9BVG3 475 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 EPS8L2Q9H6S3 715 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 LRRC19Q9H756 370 aa20.47■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NDUFS3O75489 264 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TRAF2Q12933 501 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 GARTP22102 1010 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ACADSBP45954 432 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 MARCKSL1P49006 195 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ASNA1O43681 348 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 PRKAA1Q13131 559 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 BRINP3Q76B58 766 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ZNF280CQ8ND82 737 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CHST12Q9NRB3 414 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 IL17RBQ9NRM6 502 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 EDF1O60869 148 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ATP6V1B2P21281 511 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 NRF1Q16656 503 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 CCDC153Q494R4 210 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 TSPAN14Q8NG11 270 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ORC1Q13415 861 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 ATF7IP2Q5U623 682 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 DLG3Q92796 817 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa20.46■□□□□ 0.87
KLHDC2-201ENST00000298307 MAPK11Q15759 364 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 MAGED4Q96JG8 741 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 PARVBQ9HBI1 364 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 PEX1O43933 1283 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 TRIM13O60858 407 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 PKNOX1P55347 436 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 PPATQ06203 517 aa20.45■□□□□ 0.86
KLHDC2-201ENST00000298307 SLC5A9Q2M3M2 681 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms