RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 EFCAB12Q6NXP0 572 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 RXFP2Q8WXD0 754 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 MINDY3Q9H8M7 445 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 USP29Q9HBJ7 922 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 CNTN3Q9P232 1028 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 HEY2Q9UBP5 337 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1257Q9ULG3 409 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 KCNH4Q9UQ05 1017 aa29.15■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 GJB1P08034 283 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 PDGFRAP16234 1089 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 TGM2P21980 687 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 CDK16Q00536 496 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 FAM187BQ17R55 369 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 LRRC6Q86X45 466 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 FAM111AQ96PZ2 611 aa29.14■■■□□ 2.26
UBP1-201ENST00000283628 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PYGBP11216 843 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 GM2AP17900 193 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 NRLP54845 237 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 POU5F1BQ06416 359 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 INCA1Q0VD86 236 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 MOB2Q70IA6 237 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 USP6NLQ92738 828 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SKA1Q96BD8 255 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SPATA33Q96N06 139 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 RAB6BQ9NRW1 208 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 LRRC42Q9Y546 428 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 NUMBLQ9Y6R0 609 aa29.14■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CNMDO75829 334 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PHKA2P46019 1235 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 KRT81Q14533 505 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 BTBD10Q9BSF8 475 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SOCS7O14512 581 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 KRT37O76014 449 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 NEFHP12036 1026 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 MAGEA6P43360 314 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 CLCN3P51790 818 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 TAF11Q15544 211 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 KYAT1Q16773 422 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 BOLA3Q53S33 107 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 LCLAT1Q6UWP7 414 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 TTLL3Q9Y4R7 772 aa29.13■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 GSTA2P09210 222 aa29.12■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 CMPK2Q5EBM0 449 aa29.12■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 TRNP1Q6NT89 227 aa29.12■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 PLD5Q8N7P1 536 aa29.12■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 UBA3Q8TBC4 463 aa29.12■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa29.12■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 C1QAP02745 245 aa29.11■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 C4orf22Q6V702 233 aa29.11■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa29.11■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 LRRC39Q96DD0 335 aa29.11■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 STAU1O95793 577 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 STILQ15468 1287 aa29.11■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 FAM91A1Q658Y4 838 aa29.11■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP29.11■■■□□ 2.25
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UBP1-201ENST00000283628 CFAP36Q96G28 342 aa29.11■■■□□ 2.25
UBP1-201ENST00000283628 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
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