RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.46■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 LRRC40Q9H9A6 602 aa22.46■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 MTSS1O43312 755 aa22.45■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 SLC25A27O95847 323 aa22.45■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 THRAP10827 490 aa22.45■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 RBBP7Q16576 425 aa22.45■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa22.45■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.45■■□□□ 1.19
USP12-201ENST00000282344 MEI4A8MW99 385 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 RFWD2Q8NHY2 731 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 WNK4Q96J92 1243 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SRP72O76094 671 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CES3Q6UWW8 571 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SLFN11Q7Z7L1 901 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CCNJLQ8IV13 435 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 AKT1S1Q96B36 256 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 RGL2O15211 777 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SUPT7LO94864 414 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SV2CQ496J9 727 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 VAV3Q9UKW4 847 aa22.45■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 PSMD3O43242 534 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 JCHAINP01591 159 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 GRK2P25098 689 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 RBL1P28749 1068 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 NUMBP49757 651 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 TAS2R40P59535 323 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CNTN2Q02246 1040 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 DPYSL3Q14195 570 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 NOTUMQ6P988 496 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 LIASO43766 372 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 MT-CO1P00395 513 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 APOC2P02655 101 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 RNF148Q8N7C7 305 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SOX13Q9UN79 622 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CPB1P15086 417 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 LY6KQ17RY6 165 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SEL1L3Q68CR1 1132 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 FAM83AQ86UY5 434 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.44■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 FOXO6A8MYZ6 492 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 KCNK1O00180 336 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 PDE5AO76074 875 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SLC45A4Q5BKX6 768 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SLITRK1Q96PX8 696 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 COG5Q9UP83 839 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 PIK3C2AO00443 1686 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 MPP3Q13368 585 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SEMA4DQ92854 862 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CNDP1Q96KN2 507 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 WDCPQ9H6R7 721 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 NID2Q14112 1375 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 TIMM44O43615 452 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 KDELR1P24390 212 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CDK16Q00536 496 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 C16orf46Q6P387 395 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 FAM8A1Q9UBU6 413 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 FANCGO15287 622 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 FKBP6O75344 327 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SNHG28P0DPA3 235 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 SERPINB8P50452 374 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 MGAT5Q09328 741 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 STX5Q13190 355 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 LAMC2Q13753 1193 aa22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 WNT10BO00744 389 aa22.42■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 METTL7BQ6UX53 244 aa22.42■■□□□ 1.18
USP12-201ENST00000282344 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms