RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 ULBP1Q9BZM6 244 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 FBXL21Q9UKT6 434 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa23.46■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa23.45■■□□□ 1.35
SYF2-201ENST00000236273 THAP12O43422 761 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CAVIN2O95810 425 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 RGS7P49802 495 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 JAM2P57087 298 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF276Q8N554 614 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 DNASE1L2Q92874 299 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 IRF7Q92985 503 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 HSFY1Q96LI6 401 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP23.45■■□□□ 1.341e-7■□□□□ 10.4
SYF2-201ENST00000236273 CPQQ9Y646 472 aa23.45■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GTH6 734 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 F8VZ95 297 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 LEFTY2O00292 366 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ZBED1O96006 694 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PDE6CP51160 858 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 STARD6P59095 220 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PFKPQ01813 784 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ADIGQ0VDE8 80 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 SCML4Q8N228 414 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ARHGEF3Q9NR81 526 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 HEBP1Q9NRV9 189 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 GKN1Q9NS71 199 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGC3Q9UN70 934 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 F5P12259 2224 aa23.44■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MED7O43513 233 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TLR5O60602 858 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 RARGP13631 454 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PTK2Q05397 1052 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TNK2Q07912 1038 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MTF1Q14872 753 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 NR1I3Q14994 352 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 WBP2Q969T9 261 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 LRRC4Q9HBW1 653 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 HPS4Q9NQG7 708 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 NUDT5Q9UKK9 219 aa23.43■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PIK3R2O00459 728 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 LCP1P13796 627 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PSEN1P49768 467 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TRIM68Q6AZZ1 485 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 YAF2Q8IY57 180 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 FBXL6Q8N531 539 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 STK32AQ8WU08 396 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A5Q9BY07 1137 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 LINC00597Q9H2U6 94 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CNGB3Q9NQW8 809 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 GTSE1Q9NYZ3 720 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 NAGPAQ9UK23 515 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF318Q5VUA4 2279 aa23.42■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 YJEFN3A6XGL0 299 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 E7ENQ6 273 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MDM4O15151 490 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 GREM1O60565 184 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CYP11B1P15538 503 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 DAOAP59103 153 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC10Q6PID8 442 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 OSCP1Q8WVF1 389 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CHFRQ96EP1 664 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 LHX5Q9H2C1 402 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.41■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PI15O43692 258 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ARSAP15289 507 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 BPIFB4P59827 614 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PLCB2Q00722 1185 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 PRKCQQ04759 706 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TMEM110Q86TL2 294 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ZNF687Q8N1G0 1237 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TJP2Q9UDY2 1190 aa23.4■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 CD72P21854 359 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 VCPP55072 806 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 FANCCQ00597 558 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 EML3Q32P44 896 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1958Q8N8K9 716 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 NEK11Q8NG66 645 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TTC8Q8TAM2 541 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 EBF3Q9H4W6 596 aa23.39■■□□□ 1.34
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D17Q9HA65 648 aa23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms