RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227638.7

PANX1-201, Transcript of pannexin 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PANX1, Length 2,769 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX1-201ENST00000227638 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
PANX1-201ENST00000227638 ACKR2O00590 384 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 IL4RP24394 825 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 EFNA5P52803 228 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SLC10A6Q3KNW5 377 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PMF1Q6P1K2 205 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 C7orf31Q8N865 590 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ARMC2Q8NEN0 867 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 HPDLQ96IR7 371 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TSSK1BQ9BXA7 367 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 C20orf27Q9GZN8 174 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 IFT122Q9HBG6 1241 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 NME7Q9Y5B8 376 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CSADQ9Y600 493 aa18.89■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 APOC2P02655 101 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 OLIG2Q13516 323 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 KRT81Q14533 505 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TAF11Q15544 211 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 MROH9Q5TGP6 573 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 RINLQ6ZS11 566 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 GRAMD1AQ96CP6 724 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CLPTM1LQ96KA5 538 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 COX16Q9P0S2 106 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 AKT3Q9Y243 479 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CILPO75339 1184 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 GABBR2O75899 941 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 INHBAP08476 426 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 GBE1Q04446 702 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 IKBKGQ9Y6K9 419 aa18.88■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 MYL2P10916 166 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ALDH3A1P30838 453 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PHBP35232 272 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 GPC2Q8N158 579 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 WDR60Q8WVS4 1066 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ACSS2Q9NR19 701 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 METTL18O95568 372 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 INSRRP14616 1297 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PROZP22891 400 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ADORA2AP29274 412 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CCDC14Q49A88 953 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SH3D19Q5HYK7 790 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 C16orf46Q6P387 395 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 POLNQ7Z5Q5 900 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PYROXD2Q8N2H3 581 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PLD5Q8N7P1 536 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PCDH19Q8TAB3 1148 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 FZD8Q9H461 694 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 USP29Q9HBJ7 922 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ENO4A6NNW6 628 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 KRT36O76013 467 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PFKMP08237 780 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CSH1P0DML2 217 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CSH2P0DML3 217 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PQLC3Q8N755 202 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CXorf38Q8TB03 319 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 DHRS4Q9BTZ2 278 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 APOL6Q9BWW8 343 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 FOXP3Q9BZS1 431 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 STRIP2Q9ULQ0 834 aa18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PDGFRBP09619 1106 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 TPBGLP0DKB5 382 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ARFIP2P53365 341 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 RCN2Q14257 317 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CES3Q6UWW8 571 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 ILDR2Q71H61 639 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 FAM172AQ8WUF8 416 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 CYTH2Q99418 400 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa18.86■□□□□ 0.61
PANX1-201ENST00000227638 PCMTD2Q9NV79 361 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.2 ms