RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HemgnQ9ERZ0 503 aa13.18□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp612A0A1D5RMC2 672 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 JrklB2RRL2 523 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itga9B8JK39 1036 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3252E9PUT9 216 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3468E9QAJ8 216 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uimc1Q5U5Q9 727 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CochQ62507 552 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf168Q80XJ2 565 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acbd3Q8BMP6 525 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl5Q8C2S5 690 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gtpbp10Q8K013 366 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alas1Q8VC19 642 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmprss4Q8VCA5 435 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox16Q9CR63 106 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adrm1Q9JKV1 407 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr46Q9Z0H1 622 aaKnown RBP13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4788E9Q8B5 879 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6583E9Q8Z1 469 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl33G3UW92 533 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DffaO54786 331 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rag1P15919 1040 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dpep1P31428 410 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kif5aP33175 1027 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oaz1P54369 227 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp1Q01514 589 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Runx2Q08775 607 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstt2Q61133 244 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpc5Q8CAL5 572 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 VasnQ9CZT5 673 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mgea5Q9EQQ9 916 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpm5Q9JJH7 1158 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bnip3lQ9Z2F7 218 aa13.17□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itpripl1A2ASA8 547 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup10A2BIN1 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup14A2CEK7 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup19A9C497 187 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup15A9R9W0 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa5b1A9Z1V5 1215 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup17B5X0G2 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup8E9PVW0 235 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1354E9Q5G9 310 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup7E9QA79 235 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2610008E11RikG3X964 669 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup6P02762 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nr3c1P06537 783 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup1P11588 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mup2P11589 180 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chrm1P12657 460 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epas1P97481 874 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IhhP97812 411 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndst1Q3UHN9 882 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg9bQ6EBV9 922 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd300aQ6SJQ0 318 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr151Q7TSN6 422 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HomezQ80W88 542 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Castor2Q8CAB8 329 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kdm1bQ8CIG3 826 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim68Q8K243 485 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gga1Q8R0H9 635 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zdhhc3Q8R173 299 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6ap2Q9CYN9 350 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx56Q9D0R4 546 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dgcr8Q9EQM6 773 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mindy4b-psA0A1W2P7H6 457 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E2f6O54917 272 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Myl1P05977 188 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sstr1P30873 391 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dab2P98078 766 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr15Q0VDU3 360 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb5d1Q5NCY3 228 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scube3Q66PY1 993 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ssxb5Q6XAS2 159 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r125Q7M710 311 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rhot1Q8BG51 631 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trpv6Q91WD2 767 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde6cQ91ZQ1 861 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CmasQ99KK2 432 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk5rap3Q99LM2 503 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GOLGA7BQ9D428 167 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex9Q9D845 387 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Iigp1Q9QZ85 413 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnfrsf10bQ9QZM4 381 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cib2Q9Z309 187 aa13.16□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Card9A2AIV8 536 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 XntrpcF8VQM8 1264 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NumblO08919 604 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl21O09167 160 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kpna6O35345 536 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxc8P09025 242 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 YwhaeP62259 255 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbtb14Q08376 449 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nek10Q3UGM2 1111 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spata24Q6P926 205 aa13.15□□□□□ -0.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prl3a1Q78Y73 227 aa13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 25 ms