RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 CidecP56198 239 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trim43cP86449 446 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 ADGRF3Q58Y75 991 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cldn11Q60771 207 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 ThrspQ62264 150 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tpp2Q64514 1262 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Asic1Q6NXK8 526 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stk40Q7TNL3 435 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ctdspl2Q8BG15 465 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr20Q8BYC4 358 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Afap1l1Q8BZI0 768 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 MtrrQ8C1A3 696 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spata32Q8C5V0 334 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Parp9Q8CAS9 866 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eva1bQ8K2Y3 164 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbxl12Q9EPX5 326 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 SgshQ9EQ08 502 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 IkbkeQ9R0T8 717 aa20.09■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp4a12bA2A974 508 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ajm1A2AJA9 974 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 4930544D05RikJ3QK56 214 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm8108K7N734 216 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1022L7MTT3 315 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 PlauP06869 433 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Defa-rs1P17533 116 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nol4P60954 483 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Timm13P62075 95 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc13a5Q67BT3 572 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q6PD19 689 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr212Q7TS33 327 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cmtr2Q8BWQ4 767 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dusp15Q8R4V2 235 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cts3Q91ZD5 332 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ribc1Q9D0B8 379 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q9D4A5 307 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sphk2Q9JIA7 617 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Add1Q9QYC0 735 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 ChmlQ9QZD5 621 aa20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tjp2Q9Z0U1 1167 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Grik2P39087 908 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gjb5Q02739 271 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 MplQ08351 625 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Afg1lQ3V384 480 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc6a4Q60857 630 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr19Q61121 415 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf821Q6PD05 413 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 TifaQ793I8 184 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Clic6Q8BHB9 596 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ubald2Q8BQH4 164 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lysmd3Q99LE3 305 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 CatsperzQ9CQP8 194 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Galnt15Q9D2N8 638 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rin2Q9D684 903 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tcirg1Q9JHF5 834 aa20.07■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 NuggcD3YWJ0 796 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 1700011I03RikE9PYL8 271 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm597E9Q8J5 896 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Apol10bG3X9K7 334 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc11a2P49282 568 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klrb1Q0ZUP1 214 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Srsf6Q3TWW8 339 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 CttnQ60598 546 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gpr17Q6NS65 339 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Znf775Q8BI73 538 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rbm41Q8JZV4 413 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 HnrnplQ8R081 586 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trmt11Q9CWH5 460 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam111aQ9D2L9 613 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 TnmdQ9EP64 317 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prl5a1Q9JII2 230 aa20.06■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tbc1d25A1A5B6 742 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm12394A2AKP6 982 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abcb5B5X0E4 1255 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 IghgP01863 330 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tbxa2rP30987 341 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gstt1Q64471 240 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Efcab14Q8BGQ6 484 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 B3glctQ8BHT6 489 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Med25Q8VCB2 745 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wdr45bQ9CR39 344 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tlr5Q9JLF7 859 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mx2Q9WVP9 655 aa20.05■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myo10F8VQB6 2062 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp8b4A2ANX3 1194 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm4846B2RWH8 538 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm2888K7N746 267 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wsb2O54929 404 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pla2g4bP0C871 782 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cnr2P47936 347 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Arhgef15Q5FWH6 849 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Leo1Q5XJE5 667 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Amer3Q6NS69 780 aa20.04■□□□□ 0.8
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snx31Q6P8Y7 439 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.3 ms