RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Repin1Q5U4E2 545 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TCAIMQ66JZ4 499 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf750Q8BH05 703 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfm2Q8BM13 448 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam161bQ8CB59 589 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo43Q8CDI2 640 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zmiz2Q8CIE2 920 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wipf1Q8K1I7 493 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcolce2Q8R4W6 414 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam49bQ921M7 324 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q922M7 232 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Npffr2Q924H0 417 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Card14Q99KF0 999 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 NamptQ99KQ4 491 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lpin2Q99PI5 893 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dlgap1Q9D415 992 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SgshQ9EQ08 502 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp10Q9ESS0 483 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srpk3Q9Z0G2 565 aa11.8□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc13A0A1L1SSC7 844 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 A0A1L1STL9 112 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1022L7MTT3 315 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PfklP12382 780 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf224Q3UIW8 156 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nlrc4Q3UP24 1024 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zbtb16Q3UQ17 673 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinb6Q60854 378 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dsg1aQ61495 1057 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mgat5bQ765H6 792 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1415Q7TQS4 311 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slitrk1Q810C1 696 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nol6Q8R5K4 1152 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nle1Q8VEJ4 485 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1416Q8VGU4 312 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ipo4Q8VI75 1082 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Snx9Q91VH2 595 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcdhga6Q91XY2 932 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Synpo2Q91YE8 1087 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp1r16aQ923M0 524 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tab2Q99K90 693 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 1700123K08RikQ9D991 295 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr703Q9EPF5 319 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nova1Q9JKN6 507 aaKnown RBP11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arhgef10Q8C033 1345 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dock6Q8VDR9 2080 aa11.79□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igkv5-45A0A0B4J1J1 115 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpy19l4A2AJQ3 722 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AU015836B2RUM3 263 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10720D3Z1I5 223 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wdr78E9PYY5 807 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r100E9QAZ9 850 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bin1O08539 588 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kifc3O35231 824 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Edil3O35474 480 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tlx3O55144 291 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 LdhcP00342 332 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IduaP48441 634 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Senp1P59110 640 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2hP62257 183 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ezh1P70351 747 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MybphP70402 483 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 VegfcP97953 415 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nudt18Q3U2V3 323 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Taar7aQ5QD12 358 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klra6Q60653 266 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cldn11Q60771 207 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr19Q61121 415 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sh3gl3Q62421 347 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q6PAC4 1279 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Noc4lQ8BHY2 516 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pum3Q8BKS9 647 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc9a9Q8BZ00 644 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Traf3ip3Q8C0G2 513 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syt15Q8C6N3 418 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rassf9Q8K342 435 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sgms1Q8VCQ6 419 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ube2sQ921J4 223 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fbxo32Q9CPU7 355 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rbm31yQ9D3U4 565 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rin2Q9D684 903 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 March8Q9DBD2 286 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Bod1lE9Q6J5 3032 aa11.78□□□□□ -0.52
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Odf2A3KGV1 830 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Alkbh1P0CB42 389 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc3a2P10852 526 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tsta3P23591 321 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rfx2P48379 717 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dab2ipQ3UHC7 1189 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rhox12Q4TU81 186 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyfip2Q5SQX6 1253 aa11.77□□□□□ -0.53
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igbp1Q61249 340 aa11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.6 ms