RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 FAM135BQ49AJ0 1406 aa27.5■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 WASHC2AQ641Q2 1341 aa27.5■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 TMF1P82094 1093 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 PTCH1Q13635 1447 aa27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 CCDC7Q96M83 1385 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 SLC24A1O60721 1099 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 NWD1Q149M9 1564 aa27.45■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.44■■□□□ 1.98
CLN8-208ENST00000635751 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
CLN8-208ENST00000635751 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.4■■□□□ 1.98
CLN8-208ENST00000635751 EVC2Q86UK5 1308 aa27.39■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 CDCA8Q53HL2 280 aa27.37■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 CDK19Q9BWU1 502 aa27.34■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 CABP2Q9NPB3 220 aa27.33■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.33■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 ADGRB2O60241 1585 aa27.32■■□□□ 1.96
CLN8-208ENST00000635751 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
CLN8-208ENST00000635751 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
CLN8-208ENST00000635751 MYOM1P52179 1685 aa27.29■■□□□ 1.96
CLN8-208ENST00000635751 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CLN8-208ENST00000635751 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
CLN8-208ENST00000635751 C14orf37Q86TY3 774 aa27.26■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 TMEM94Q12767 1356 aa27.25■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa27.24■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 TMC1Q8TDI8 760 aa27.22■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 LRRC7Q96NW7 1537 aa27.21■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 NUTM2FA1L443 756 aa27.21■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.21■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.2■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.2■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa27.2■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa27.19■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.18■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 USP32Q8NFA0 1604 aa27.18■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.17■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 PANK3Q9H999 370 aa27.17■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 ATP7BP35670 1465 aa27.16■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 CABP1Q9NZU7 370 aa27.15■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.14■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.13■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 ITSN1Q15811 1721 aa27.13■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.12■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa27.12■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 NINLQ9Y2I6 1382 aa27.11■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 MSH6P52701 1360 aa27.1■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.09■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 ATF3P18847 181 aa27.09■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
CLN8-208ENST00000635751 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 CD163L1Q9NR16 1453 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 DCCP43146 1447 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.06■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 CARD14Q9BXL6 1004 aa27.05■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 TERF2IPQ9NYB0 399 aa27.05■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PP64 1363 aa27.05■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 AKAP12Q02952 1782 aa27.04■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 CADPS2Q86UW7 1296 aa27.04■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.04■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.03■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 KNSTRNQ9Y448 316 aa27.02■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.01■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 MST1RQ04912 1400 aa27■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 ACEP12821 1306 aa27■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 C1orf167Q5SNV9 1468 aa26.99■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.99■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 ORAI2Q96SN7 254 aa26.99■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.99■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 NSD3Q9BZ95 1437 aa26.99■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.97■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
CLN8-208ENST00000635751 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.94■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 NEFLP07196 543 aa26.94■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 FKBP8Q14318 412 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 CCDC184Q52MB2 194 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 SLAIN2Q9P270 581 aa26.92■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 MRS2Q9HD23 443 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 KIF1AQ12756 1690 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.89■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 USP6P35125 1406 aa26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms