RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.51■■□□□ 1.99
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CLN8-208ENST00000635751 TMF1P82094 1093 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.49■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 KIF7Q2M1P5 1343 aa27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 PTCH1Q13635 1447 aa27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 STRCP1A6NGW2 1772 aa27.47■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 CCDC7Q96M83 1385 aa27.46■■□□□ 1.99
CLN8-208ENST00000635751 SLC24A1O60721 1099 aa27.46■■□□□ 1.99
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CLN8-208ENST00000635751 NWD1Q149M9 1564 aa27.45■■□□□ 1.99
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CLN8-208ENST00000635751 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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CLN8-208ENST00000635751 CDK19Q9BWU1 502 aa27.34■■□□□ 1.97
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CLN8-208ENST00000635751 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.33■■□□□ 1.97
CLN8-208ENST00000635751 ADGRB2O60241 1585 aa27.32■■□□□ 1.96
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CLN8-208ENST00000635751 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.21■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.2■■□□□ 1.95
CLN8-208ENST00000635751 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.2■■□□□ 1.94
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CLN8-208ENST00000635751 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.18■■□□□ 1.94
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CLN8-208ENST00000635751 C19orf44Q9H6X5 657 aa27.17■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 PANK3Q9H999 370 aa27.17■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 ATP7BP35670 1465 aa27.16■■□□□ 1.94
CLN8-208ENST00000635751 CABP1Q9NZU7 370 aa27.15■■□□□ 1.94
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CLN8-208ENST00000635751 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.13■■□□□ 1.93
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CLN8-208ENST00000635751 LTBP4Q8N2S1 1624 aa27.12■■□□□ 1.93
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CLN8-208ENST00000635751 DCCP43146 1447 aa27.07■■□□□ 1.92
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa27.06■■□□□ 1.92
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CLN8-208ENST00000635751 A0A1W2PP64 1363 aa27.05■■□□□ 1.92
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CLN8-208ENST00000635751 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.04■■□□□ 1.92
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CLN8-208ENST00000635751 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
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CLN8-208ENST00000635751 ACEP12821 1306 aa27■■□□□ 1.91
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CLN8-208ENST00000635751 MON2Q7Z3U7 1717 aa26.99■■□□□ 1.91
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CLN8-208ENST00000635751 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 FKBP8Q14318 412 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 CCDC184Q52MB2 194 aa26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.93■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 SLAIN2Q9P270 581 aa26.92■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 MRS2Q9HD23 443 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 KIF1AQ12756 1690 aa26.91■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.89■■□□□ 1.9
CLN8-208ENST00000635751 USP6P35125 1406 aa26.89■■□□□ 1.9
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