RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627487.2

PCBP1-AS1-315, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 668 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MLH3Q9UHC1 1453 aa8.46□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.46□□□□□ -1.05
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 EVI5O60447 810 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FOSBP53539 338 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.46□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SYCP2Q9BX26 1530 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP8.45□□□□□ -1.062e-6■■□□□ 13.9
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 STAC3Q96MF2 364 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BCL2L12Q9HB09 334 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa8.45□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MFSD10Q14728 455 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 EMILIN3Q9NT22 766 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ROCK1Q13464 1354 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DAPK1P53355 1430 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 REREQ9P2R6 1566 aa8.44□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MAP3K9P80192 1104 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 AFAP1Q8N556 730 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.43□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RAPGEF3O95398 923 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ADAM33Q9BZ11 813 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ABCC5O15440 1437 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa8.42□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PLXNC1O60486 1568 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ATP7AQ04656 1500 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ADGRL2O95490 1459 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 C9orf84Q5VXU9 1444 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PTPREP23469 700 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.41□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ABCA6Q8N139 1617 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ATP10AO60312 1499 aa8.4□□□□□ -1.06
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NCOA1Q15788 1441 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 HRCP23327 699 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.39□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PTPN5P54829 565 aa8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa8.38□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 AGLP35573 1532 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 A2MP01023 1474 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ERBINQ96RT1 1412 aa8.37□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MADDQ8WXG6 1647 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 HFM1A2PYH4 1435 aa8.36□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KIF15Q9NS87 1388 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MROH2AA6NES4 1674 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.35□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ITGAEP38570 1179 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CHIC2Q9UKJ5 165 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PTPRKQ15262 1439 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa8.34□□□□□ -1.07
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 COL9A1P20849 921 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 SETD5Q9C0A6 1442 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 C3P01024 1663 aa8.33□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 NAIPQ13075 1403 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 GOLGA8CPA6NN73 597 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 THSD4Q6ZMP0 1018 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 WNT2BQ93097 391 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KANK1Q14678 1352 aa8.32□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DPYSL4O14531 572 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CAMK2BQ13554 666 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 PROX2Q3B8N5 592 aa8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 CNTLNQ9NXG0 1405 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 DEPDC5O75140 1603 aa8.3□□□□□ -1.08
PCBP1-AS1-315ENST00000627487 KIF3BO15066 747 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms