RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623635.1

PTPRQ-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Q, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRQ, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQ-210ENST00000623635 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa13.15□□□□□ -0.3
PTPRQ-210ENST00000623635 Q3C1V9 767 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 PLA2G2CQ5R387 149 aa13.14□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 ANKLE1Q8NAG6 615 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 KDM4CQ9H3R0 1056 aa13.12□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 MSS51Q4VC12 460 aa13.1□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.09□□□□□ -0.31
PTPRQ-210ENST00000623635 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 FAM117AQ9C073 453 aa13.08□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 C6orf229H3BNL8 230 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 MYSM1Q5VVJ2 828 aa13.07□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 SPTLC1O15269 473 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 SLC19A1P41440 591 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 LIMD1Q9UGP4 676 aa13.05□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 MMP16P51512 607 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa13.04□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 DXOO77932 396 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 DIXDC1Q155Q3 683 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 RETREG3Q86VR2 466 aa13.03□□□□□ -0.32
PTPRQ-210ENST00000623635 PLEKHG3A1L390 1219 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 NEUROD2Q15784 382 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 CABLES1Q8TDN4 633 aa13.01□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 SPRYD7Q5W111 196 aa13□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 POLR3EQ9NVU0 708 aa13□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 JUNDP17535 347 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 GJA5P36382 358 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 MTMR2Q13614 643 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR7Q8TB68 274 aa12.99□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 HRCP23327 699 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 QPCTQ16769 361 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.98□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 CFAP99D6REC4 459 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 CCDC24Q8N4L8 307 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRQ-210ENST00000623635 CLK2P49760 499 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 TRIM67Q6ZTA4 783 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.93□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 RSPH6AQ9H0K4 717 aa12.93□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 GFRA3O60609 400 aa12.92□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 SPDYE5A6NIY4 337 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 LILRB3O75022 631 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 RPIAP49247 311 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 IL27Q8NEV9 243 aa12.91□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 TUSC1Q2TAM9 212 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 NUDT12Q9BQG2 462 aa12.9□□□□□ -0.34
PTPRQ-210ENST00000623635 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 LAPTM4AQ15012 233 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 SH3D19Q5HYK7 790 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 TNFRSF10AO00220 468 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 GDF9O60383 454 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 FOXC1Q12948 553 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 TRIM32Q13049 653 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 Q6ZNB5 142 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 TSC1Q92574 1164 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 PKD2L1Q9P0L9 805 aa12.86□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 CCNYL3P0C7X3 344 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 PTPRNQ16849 979 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 DESI1Q6ICB0 168 aa12.85□□□□□ -0.35
PTPRQ-210ENST00000623635 LYPD8Q6UX82 237 aa12.83□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP12.83□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 EVA1BQ9NVM1 165 aa12.82□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 SKOR1P84550 965 aa12.81□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 KCNH2Q12809 1159 aa12.8□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR20EP86478 221 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR20CP86479 221 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR20DP86480 221 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR20BP86481 221 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 PRR20AP86496 221 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 MAP10Q9P2G4 905 aa12.79□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 LCE2BO14633 110 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 UNC93B1Q9H1C4 597 aa12.78□□□□□ -0.36
PTPRQ-210ENST00000623635 CTHP32929 405 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRQ-210ENST00000623635 CTDSPL2Q05D32 466 aa12.77□□□□□ -0.37
PTPRQ-210ENST00000623635 F12P00748 615 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
PTPRQ-210ENST00000623635 LINC01559Q495D7 138 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms