RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 TSPYL4Q9UJ04 414 aa18.83■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.61
PTPRT-210ENST00000617474 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.83■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 MAPKBP1O60336 1514 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TEFQ10587 303 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CHMP4AQ9BY43 222 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TAF7LQ5H9L4 462 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 FBXW7Q969H0 707 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 STAC3Q96MF2 364 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 SMC3Q9UQE7 1217 aa18.82■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 BICD2Q8TD16 824 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TPM4P67936 248 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TOMM22Q9NS69 142 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 FOSBP53539 338 aa18.81■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC27Q2M243 656 aa18.8■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 HMGXB3Q12766 1538 aa18.78■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 ESPNB1AK53 854 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 DUSP27Q5VZP5 1158 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP18.77■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 RUFY2Q8WXA3 655 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 EID1Q9Y6B2 187 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRT-210ENST00000617474 TOPBP1Q92547 1522 aa18.77■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 NUTM2GQ5VZR2 741 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 CHD1LQ86WJ1 897 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 WDR63Q8IWG1 891 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 ROCK1Q13464 1354 aa18.76■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 KIF3AQ9Y496 699 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 PTPRKQ15262 1439 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 RABEP1Q15276 862 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF428Q96B54 188 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 PRAM1Q96QH2 718 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 TBC1D2Q9BYX2 928 aa18.75■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 FIBPO43427 364 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 RARSP54136 660 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 IFT57Q9NWB7 429 aa18.74■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 IGHDP01880 384 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 GCC1Q96CN9 775 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 GRIN2BQ13224 1484 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 SURF6O75683 361 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 ABCC5O15440 1437 aa18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 CABP1Q9NZU7 370 aa18.72■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 SSH1Q8WYL5 1049 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC173Q0VFZ6 552 aa18.71■□□□□ 0.59
PTPRT-210ENST00000617474 SLC4A2P04920 1241 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC39Q9UFE4 941 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 MBD3O95983 291 aa18.69■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TMPOP42166 694 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SULT6B1Q6IMI4 303 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 PTPN23Q9H3S7 1636 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 NEXNQ0ZGT2 675 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SASS6Q6UVJ0 657 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SPC24Q8NBT2 197 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 HOMER1Q86YM7 354 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 NSD3Q9BZ95 1437 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 RNF20Q5VTR2 975 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 TSPY26PQ9H489 355 aa18.66■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 MAP3K1Q13233 1512 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CYB5RLQ6IPT4 315 aa18.65■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SYNJ2O15056 1496 aa18.64■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 CCDC34Q96HJ3 373 aa18.64■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.64■□□□□ 0.58
PTPRT-210ENST00000617474 NINLQ9Y2I6 1382 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 HECW1Q76N89 1606 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 CPLX1O14810 134 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 TPM2P07951 284 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 ERC2O15083 957 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 TRIM5Q9C035 493 aa18.64■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 GNAI3P08754 354 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 NLRP6P59044 892 aa18.63■□□□□ 0.57
PTPRT-210ENST00000617474 DISP3Q9P2K9 1392 aa18.63■□□□□ 0.57
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