RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613811.4

RAPGEFL1-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor like 1, human

TSL 1 (best)

Gene RAPGEFL1, Length 1,744 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MYOM1	P52179	1685 aa		42.62	■■■■■ 4.41
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CDCA8	Q53HL2	280 aa		42.62	■■■■■ 4.41
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		42.62	■■■■■ 4.41
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PTCH1	Q13635	1447 aa		42.59	■■■■■ 4.41
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	42.59	■■■■■ 4.41
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	EVC2	Q86UK5	1308 aa		42.55	■■■■■ 4.4
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	42.54	■■■■■ 4.4
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KCNA6	P17658	529 aa		42.49	■■■■■ 4.39
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NWD1	Q149M9	1564 aa		42.48	■■■■■ 4.39
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ADGRB2	O60241	1585 aa		42.45	■■■■■ 4.39
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MIER1	Q8N108	512 aa		42.43	■■■■■ 4.38
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	42.42	■■■■■ 4.38
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CABP2	Q9NPB3	220 aa		42.41	■■■■■ 4.38
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CDK19	Q9BWU1	502 aa		42.38	■■■■■ 4.38
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		42.36	■■■■■ 4.37
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PANK3	Q9H999	370 aa		42.34	■■■■■ 4.37
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		42.32	■■■■■ 4.37
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		42.3	■■■■■ 4.36
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ANP32C	O43423	234 aa		42.27	■■■■■ 4.36
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TMC1	Q8TDI8	760 aa		42.26	■■■■■ 4.36
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		42.26	■■■■■ 4.36
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		42.22	■■■■■ 4.35
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ATP7B	P35670	1465 aa		42.2	■■■■■ 4.35
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	42.19	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	USP32	Q8NFA0	1604 aa		42.18	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		42.18	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		42.17	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		42.16	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	42.14	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		42.14	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	42.14	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		42.14	■■■■■ 4.34
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		42.13	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		42.12	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	42.12	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		42.11	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CABP1	Q9NZU7	370 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ITSN1	Q15811	1721 aa		42.1	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	42.09	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		42.09	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811		A0A1W2PP64	1363 aa		42.08	■■■■■ 4.33
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NUTM2F	A1L443	756 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		42.06	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	42.03	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	AKAP12	Q02952	1782 aa		42.03	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TMEM94	Q12767	1356 aa		42.02	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	42.02	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	C14orf37	Q86TY3	774 aa		42.02	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		42.01	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KTN1	Q86UP2	1357 aa	Known RBP	42.01	■■■■■ 4.32
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	41.98	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		41.98	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	41.96	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		41.96	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		41.96	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		41.96	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	41.95	■■■■■ 4.31
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		41.93	■■■■■ 4.3
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CCER2	I3L3R5	266 aa		41.92	■■■■■ 4.3
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	RALBP1	Q15311	655 aa		41.9	■■■■■ 4.3
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		41.89	■■■■■ 4.3
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		41.89	■■■■■ 4.3
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		41.88	■■■■■ 4.29
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		41.86	■■■■■ 4.29
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ACE	P12821	1306 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	DCC	P43146	1447 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		41.84	■■■■■ 4.29
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		41.83	■■■■■ 4.29
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	41.82	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		41.81	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	41.8	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	41.79	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	41.79	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	41.78	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NSD2	O96028	1365 aa		41.77	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MSH6	P52701	1360 aa		41.77	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CCDC184	Q52MB2	194 aa		41.77	■■■■■ 4.28
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	USP6	P35125	1406 aa		41.75	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ATF3	P18847	181 aa		41.74	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	MST1R	Q04912	1400 aa		41.74	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		41.73	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	41.72	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	41.72	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		41.71	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	FYB1	O15117	783 aa		41.7	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		41.7	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		41.69	■■■■■ 4.27
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		41.68	■■■■■ 4.26
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	SSH2	Q76I76	1423 aa		41.68	■■■■■ 4.26
RAPGEFL1-211	ENST00000613811	KIF1A	Q12756	1690 aa		41.67	■■■■■ 4.26

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