RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 WAPLQ7Z5K2 1190 aa29.27■■■□□ 2.28
LTBP4-232ENST00000610893 SIRT1Q96EB6 747 aa29.26■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 IFT172Q9UG01 1749 aa29.25■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 PNPLA6Q8IY17 1366 aa29.24■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.22■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 NRXN1Q9ULB1 1477 aa29.21■■■□□ 2.27
LTBP4-232ENST00000610893 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.2■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 MYOM2P54296 1465 aa29.2■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa29.2■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 LAMC1P11047 1609 aa29.19■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.19■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa29.16■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 STAC3Q96MF2 364 aa29.16■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 AFF2P51816 1311 aa29.15■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 RXRBP28702 533 aa29.14■■■□□ 2.26
LTBP4-232ENST00000610893 FOXO3O43524 673 aa29.13■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 C8orf37Q96NL8 207 aa29.13■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 KNDC1Q76NI1 1749 aa29.12■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 NUTM2FA1L443 756 aa29.11■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.09■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 NGLY1Q96IV0 654 aa29.09■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 ADAMTS2O95450 1211 aa29.08■■■□□ 2.25
LTBP4-232ENST00000610893 PRAM1Q96QH2 718 aa29.07■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.07■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 POGKQ9P215 609 aa29.05■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 PXDNQ92626 1479 aa29.04■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
LTBP4-232ENST00000610893 DLC1Q96QB1 1528 aa29■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.98■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.98■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.98■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 TRAK1Q9UPV9 953 aa28.98■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 ADGRB1O14514 1584 aa28.97■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 USP21Q9UK80 565 aa28.97■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 PSME1Q06323 249 aa28.96■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.95■■■□□ 2.23
LTBP4-232ENST00000610893 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
LTBP4-232ENST00000610893 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP28.92■■■□□ 2.22
LTBP4-232ENST00000610893 KIF1AQ12756 1690 aa28.92■■■□□ 2.22
LTBP4-232ENST00000610893 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.9■■■□□ 2.22
LTBP4-232ENST00000610893 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP28.87■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 SBNO1A3KN83 1393 aa28.86■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 ADGRB2O60241 1585 aa28.84■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.84■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 RGS12O14924 1447 aa28.84■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.83■■■□□ 2.21
LTBP4-232ENST00000610893 ATRNO75882 1429 aa28.82■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.81■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 ARHGEF10O15013 1369 aa28.8■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.78■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.77■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.77■■■□□ 2.2
LTBP4-232ENST00000610893 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.75■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.75■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 USP32Q8NFA0 1604 aa28.75■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 SLIT2O94813 1529 aa28.73■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
LTBP4-232ENST00000610893 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.7■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.7■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 CDK19Q9BWU1 502 aa28.69■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 PLEKHG5O94827 1062 aa28.68■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.67■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.65■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 FAM83GA6ND36 823 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 VPS72Q15906 364 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC61Q9Y6R9 512 aa28.64■■■□□ 2.18
LTBP4-232ENST00000610893 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 ATP7BP35670 1465 aa28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.61■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.6■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 PLEKHG3A1L390 1219 aa28.59■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC125Q86Z20 511 aa28.58■■■□□ 2.17
LTBP4-232ENST00000610893 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.57■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 ACEP12821 1306 aa28.56■■■□□ 2.16
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
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