RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 ORAI2Q96SN7 254 aa28■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 MYOM2P54296 1465 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.98■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 NUTM2FA1L443 756 aa27.96■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 TECPR2O15040 1411 aa27.95■■■□□ 2.07
ANKRD54-211ENST00000609454 POGKQ9P215 609 aa27.94■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 POTEAQ6S8J7 498 aa27.93■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 STAC3Q96MF2 364 aa27.93■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 SIRT1Q96EB6 747 aa27.92■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 SHPRHQ149N8 1683 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.91■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 LAMC1P11047 1609 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 PRAM1Q96QH2 718 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.89■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.89■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 LRP6O75581 1613 aa27.88■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 KNDC1Q76NI1 1749 aa27.87■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.86■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 FOXO3O43524 673 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 PNPLA6Q8IY17 1366 aa27.85■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 C8orf37Q96NL8 207 aa27.83■■■□□ 2.05
ANKRD54-211ENST00000609454 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
ANKRD54-211ENST00000609454 ADAMTS2O95450 1211 aa27.8■■■□□ 2.04
ANKRD54-211ENST00000609454 AFF2P51816 1311 aa27.78■■■□□ 2.04
ANKRD54-211ENST00000609454 NGLY1Q96IV0 654 aa27.77■■■□□ 2.04
ANKRD54-211ENST00000609454 RXRBP28702 533 aa27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 DLC1Q96QB1 1528 aa27.74■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.74■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 PSME1Q06323 249 aa27.73■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.72■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRB1O14514 1584 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.71■■■□□ 2.03
ANKRD54-211ENST00000609454 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 LMOD2Q6P5Q4 547 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 PXDNQ92626 1479 aa27.68■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 KIF1AQ12756 1690 aa27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 NEUROD1Q13562 356 aa27.66■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHG5O94827 1062 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 USP21Q9UK80 565 aa27.64■■■□□ 2.02
ANKRD54-211ENST00000609454 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.63■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.63■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 SIN3AQ96ST3 1273 aa27.6■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.59■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 L3MBTL2Q969R5 705 aa27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 ADGRB2O60241 1585 aa27.57■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.57■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.55■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.55■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 SBNO1A3KN83 1393 aa27.54■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF10O15013 1369 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 CDK19Q9BWU1 502 aa27.53■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
ANKRD54-211ENST00000609454 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.51■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.5■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 USP32Q8NFA0 1604 aa27.48■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
ANKRD54-211ENST00000609454 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.43■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 RGS12O14924 1447 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 ATRNO75882 1429 aa27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 ATP7BP35670 1465 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.39■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.39■■□□□ 1.98
ANKRD54-211ENST00000609454 TONSLQ96HA7 1378 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 ITSN1Q15811 1721 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 ACEP12821 1306 aa27.37■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 CABP2Q9NPB3 220 aa27.36■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.35■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 SLIT2O94813 1529 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 PLEKHG3A1L390 1219 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 FAM83GA6ND36 823 aa27.33■■□□□ 1.97
ANKRD54-211ENST00000609454 EVC2Q86UK5 1308 aa27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.1 ms