RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603544.5

KIAA0391-205, Transcript of KIAA0391, human

TSL 5 BASIC

Gene KIAA0391, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA0391-205	ENST00000603544	SHPRH	Q149N8	1683 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	USP32	Q8NFA0	1604 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	PTPRM	P28827	1452 aa		12.07	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	EVC2	Q86UK5	1308 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	APAF1	O14727	1248 aa		12.06	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	MLEC	Q14165	292 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	MORC1	Q86VD1	984 aa		12.05	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	ALK	Q9UM73	1620 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	GOLGA2	Q08379	1002 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		12.04	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	SPATA31D1	Q6ZQQ2	1576 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	SLFN5	Q08AF3	891 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	PRAM1	Q96QH2	718 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		12.03	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	MSH5	O43196	834 aa		12.02	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	A2ML1	A8K2U0	1454 aa		12.02	□□□□□ -0.48
KIAA0391-205	ENST00000603544	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		12.02	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	12.02	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544		A0A1W2PP64	1363 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	CRBN	Q96SW2	442 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		12.01	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	MTHFS	P49914	203 aa		12	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		12	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		12	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		11.99	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	ABCC11	Q96J66	1382 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	POGK	Q9P215	609 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		11.98	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	NSD2	O96028	1365 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		11.97	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	RRP7A	Q9Y3A4	280 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
KIAA0391-205	ENST00000603544	NLRP1	Q9C000	1473 aa		11.96	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		11.96	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544		E9PSI1	815 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	NEUROD2	Q15784	382 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	CDK19	Q9BWU1	502 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	ZMYM3	Q14202	1370 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		11.95	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	SKAP1	Q86WV1	359 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	TCP11L2	Q8N4U5	519 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	RUNDC1	Q96C34	613 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	FYB1	O15117	783 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	BCAR3	O75815	825 aa		11.94	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	DLC1	Q96QB1	1528 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	CABP1	Q9NZU7	370 aa		11.93	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	NGEF	Q8N5V2	710 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	CFAP53	Q96M91	514 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	MET	P08581	1390 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		11.92	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	11.91	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	11.91	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	KIF20B	Q96Q89	1820 aa		11.91	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	ADGRB2	O60241	1585 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	MED14	O60244	1454 aa		11.9	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
KIAA0391-205	ENST00000603544	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	TNR	Q92752	1358 aa		11.89	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	FBLN1	P23142	703 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		11.88	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51	2e-6	■■□□□ 13.2
KIAA0391-205	ENST00000603544	ATP7B	P35670	1465 aa		11.87	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	CCDC27	Q2M243	656 aa		11.87	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	11.87	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		11.87	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		11.86	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	WDR63	Q8IWG1	891 aa		11.86	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		11.86	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		11.85	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	PDE4A	P27815	886 aa		11.85	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		11.85	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		11.85	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	TECPR2	O15040	1411 aa		11.84	□□□□□ -0.51
KIAA0391-205	ENST00000603544	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	11.84	□□□□□ -0.51

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