RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602111.5

FCHO1-236, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-236ENST00000602111 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa21.54■■□□□ 1.04
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FCHO1-236ENST00000602111 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-236ENST00000602111 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
FCHO1-236ENST00000602111 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-236ENST00000602111 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.52■■□□□ 1.04
FCHO1-236ENST00000602111 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
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FCHO1-236ENST00000602111 CLTCL1P53675 1640 aa21.48■■□□□ 1.03
FCHO1-236ENST00000602111 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.48■■□□□ 1.03
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FCHO1-236ENST00000602111 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-236ENST00000602111 ROCK1Q13464 1354 aa21.44■■□□□ 1.02
FCHO1-236ENST00000602111 SLIT2O94813 1529 aa21.43■■□□□ 1.02
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FCHO1-236ENST00000602111 SEPT12Q8IYM1 358 aa21.42■■□□□ 1.02
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FCHO1-236ENST00000602111 A0A0G2JS52 829 aa21.35■■□□□ 1.01
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FCHO1-236ENST00000602111 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.28■■□□□ 1
FCHO1-236ENST00000602111 KIF1AQ12756 1690 aa21.28■■□□□ 1
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FCHO1-236ENST00000602111 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.26■□□□□ 0.99
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FCHO1-236ENST00000602111 FMN2Q9NZ56 1722 aa21.25■□□□□ 0.99
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FCHO1-236ENST00000602111 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
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FCHO1-236ENST00000602111 CAMKK2Q96RR4 588 aa21.06■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa21.05■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.05■□□□□ 0.96
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FCHO1-236ENST00000602111 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 APBA3O96018 575 aa21.03■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.03■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.03■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 RREB1Q92766 1687 aa21.02■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.02■□□□□ 0.96
FCHO1-236ENST00000602111 PIK3C2GO75747 1445 aa21.01■□□□□ 0.95
FCHO1-236ENST00000602111 ALS2Q96Q42 1657 aa20.99■□□□□ 0.95
FCHO1-236ENST00000602111 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa20.99■□□□□ 0.95
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