RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 FMN2Q9NZ56 1722 aa22.13■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 TECPR2O15040 1411 aa22.12■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa22.11■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 NUTM2FA1L443 756 aa22.09■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 AFF2P51816 1311 aa22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
FCHO1-231ENST00000600201 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 MYOM2P54296 1465 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 PXDNQ92626 1479 aa22.07■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 ABCC11Q96J66 1382 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 C8orf37Q96NL8 207 aa22.05■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 CFAP70Q5T0N1 1121 aa22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 ADAMTS2O95450 1211 aa22.03■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 ESCO1Q5FWF5 840 aa22.02■■□□□ 1.12
FCHO1-231ENST00000600201 USP32Q8NFA0 1604 aa22.01■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 RGS12O14924 1447 aa22■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 ADGRB1O14514 1584 aa21.99■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 KIF1AQ12756 1690 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 FOXO3O43524 673 aa21.98■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 RXRBP28702 533 aa21.96■■□□□ 1.11
FCHO1-231ENST00000600201 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 ABCA3Q99758 1704 aa21.94■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 NPHP3Q7Z494 1330 aa21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 DLC1Q96QB1 1528 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 NGLY1Q96IV0 654 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 PRAM1Q96QH2 718 aa21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 ADGRB2O60241 1585 aa21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.9■■□□□ 1.1
FCHO1-231ENST00000600201 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 USP21Q9UK80 565 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 ATRNO75882 1429 aa21.87■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 BCL9LQ86UU0 1499 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 SIRT1Q96EB6 747 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 TRAK1Q9UPV9 953 aa21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHG5O94827 1062 aa21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.85■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa21.84■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 KRT28Q7Z3Y7 464 aa21.83■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.83■■□□□ 1.09
FCHO1-231ENST00000600201 GLI3P10071 1580 aa21.82■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 PRR36Q9H6K5 1346 aa21.82■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 TNS3Q68CZ2 1445 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 CABLES1Q8TDN4 633 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 POGKQ9P215 609 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 ALS2Q96Q42 1657 aa21.81■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.8■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 SLIT2O94813 1529 aa21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 TULP4Q9NRJ4 1543 aa21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 EP400Q96L91 3159 aa21.79■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 ANKARQ7Z5J8 1434 aa21.78■■□□□ 1.08
FCHO1-231ENST00000600201 HRCP23327 699 aa21.76■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 NRAPQ86VF7 1730 aa21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 ITSN1Q15811 1721 aa21.75■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 SBNO1A3KN83 1393 aa21.74■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 ATP7BP35670 1465 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 NWD2Q9ULI1 1742 aa21.73■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 RALGAPBQ86X10 1494 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.72■■□□□ 1.07
FCHO1-231ENST00000600201 WASLO00401 505 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 PSME1Q06323 249 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 NBPF1Q3BBV0 1214 aa21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 UNC5CLQ8IV45 518 aa21.67■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.66■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF10O15013 1369 aa21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 QRICH2Q9H0J4 1663 aa21.65■■□□□ 1.06
FCHO1-231ENST00000600201 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 FAM83GA6ND36 823 aa21.63■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa21.61■■□□□ 1.05
FCHO1-231ENST00000600201 STAC3Q96MF2 364 aa21.6■■□□□ 1.05
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