RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596309.5

FCHO1-212, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-212ENST00000596309 PRAM1Q96QH2 718 aa27.49■■□□□ 1.99
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FCHO1-212ENST00000596309 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
FCHO1-212ENST00000596309 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.99
FCHO1-212ENST00000596309 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.45■■□□□ 1.98
FCHO1-212ENST00000596309 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.45■■□□□ 1.98
FCHO1-212ENST00000596309 NALCNQ8IZF0 1738 aa27.44■■□□□ 1.98
FCHO1-212ENST00000596309 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.43■■□□□ 1.98
FCHO1-212ENST00000596309 SLAIN2Q9P270 581 aa27.42■■□□□ 1.98
FCHO1-212ENST00000596309 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
FCHO1-212ENST00000596309 ADGRB2O60241 1585 aa27.39■■□□□ 1.97
FCHO1-212ENST00000596309 SLC24A1O60721 1099 aa27.36■■□□□ 1.97
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FCHO1-212ENST00000596309 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.35■■□□□ 1.97
FCHO1-212ENST00000596309 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa27.32■■□□□ 1.96
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FCHO1-212ENST00000596309 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.31■■□□□ 1.96
FCHO1-212ENST00000596309 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.31■■□□□ 1.96
FCHO1-212ENST00000596309 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.29■■□□□ 1.96
FCHO1-212ENST00000596309 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.28■■□□□ 1.96
FCHO1-212ENST00000596309 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
FCHO1-212ENST00000596309 QRICH2Q9H0J4 1663 aa27.27■■□□□ 1.96
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FCHO1-212ENST00000596309 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa27.25■■□□□ 1.95
FCHO1-212ENST00000596309 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.25■■□□□ 1.95
FCHO1-212ENST00000596309 EVC2Q86UK5 1308 aa27.24■■□□□ 1.95
FCHO1-212ENST00000596309 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.23■■□□□ 1.95
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FCHO1-212ENST00000596309 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
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FCHO1-212ENST00000596309 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
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FCHO1-212ENST00000596309 CCDC61Q9Y6R9 512 aa27.15■■□□□ 1.94
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FCHO1-212ENST00000596309 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.14■■□□□ 1.93
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FCHO1-212ENST00000596309 NUTM2FA1L443 756 aa27.13■■□□□ 1.93
FCHO1-212ENST00000596309 ITSN1Q15811 1721 aa27.13■■□□□ 1.93
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FCHO1-212ENST00000596309 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.12■■□□□ 1.93
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FCHO1-212ENST00000596309 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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FCHO1-212ENST00000596309 JCADQ9P266 1359 aa26.99■■□□□ 1.91
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FCHO1-212ENST00000596309 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.96■■□□□ 1.91
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FCHO1-212ENST00000596309 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-212ENST00000596309 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
FCHO1-212ENST00000596309 AKAP12Q02952 1782 aa26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-212ENST00000596309 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
FCHO1-212ENST00000596309 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.88
FCHO1-212ENST00000596309 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa26.83■■□□□ 1.88
FCHO1-212ENST00000596309 SSH2Q76I76 1423 aa26.82■■□□□ 1.88
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