RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590720.5

PSME3-210, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-210ENST00000590720 ORAI2Q96SN7 254 aa30.08■■■□□ 2.41
PSME3-210ENST00000590720 STK26Q9P289 416 aa30.05■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 ABCC11Q96J66 1382 aa30.04■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 MYOM2P54296 1465 aa30.04■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 TMEM132EQ6IEE7 984 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 NRXN1Q9ULB1 1477 aa30.03■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.4
PSME3-210ENST00000590720 WAPLQ7Z5K2 1190 aa30.01■■■□□ 2.39
PSME3-210ENST00000590720 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa30■■■□□ 2.39
PSME3-210ENST00000590720 AFF2P51816 1311 aa29.98■■■□□ 2.39
PSME3-210ENST00000590720 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
PSME3-210ENST00000590720 ESCO1Q5FWF5 840 aa29.95■■■□□ 2.39
PSME3-210ENST00000590720 FMN2Q9NZ56 1722 aa29.94■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 C8orf37Q96NL8 207 aa29.93■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 NPHP3Q7Z494 1330 aa29.93■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.92■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 PXDNQ92626 1479 aa29.92■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 NUTM2FA1L443 756 aa29.9■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 RXRBP28702 533 aa29.9■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 SIRT1Q96EB6 747 aa29.89■■■□□ 2.38
PSME3-210ENST00000590720 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 ADAMTS2O95450 1211 aa29.87■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 KIF1AQ12756 1690 aa29.86■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 FOXO3O43524 673 aa29.85■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 HRCP23327 699 aa29.85■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 DLC1Q96QB1 1528 aa29.84■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 ADGRB1O14514 1584 aa29.83■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
PSME3-210ENST00000590720 NGLY1Q96IV0 654 aa29.82■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 PRAM1Q96QH2 718 aa29.8■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 RGS12O14924 1447 aa29.78■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP29.77■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
PSME3-210ENST00000590720 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.76■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 ADGRB2O60241 1585 aa29.76■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.75■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.74■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 USP21Q9UK80 565 aa29.74■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 POGKQ9P215 609 aa29.73■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa29.71■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 USP32Q8NFA0 1604 aa29.71■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 STAC3Q96MF2 364 aa29.71■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 PHF8Q9UPP1 1060 aa29.71■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 TRAK1Q9UPV9 953 aa29.7■■■□□ 2.35
PSME3-210ENST00000590720 KRT28Q7Z3Y7 464 aa29.69■■■□□ 2.34
PSME3-210ENST00000590720 ANKARQ7Z5J8 1434 aa29.69■■■□□ 2.34
PSME3-210ENST00000590720 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
PSME3-210ENST00000590720 ATRNO75882 1429 aa29.68■■■□□ 2.34
PSME3-210ENST00000590720 TNS3Q68CZ2 1445 aa29.67■■■□□ 2.34
PSME3-210ENST00000590720 BCL9LQ86UU0 1499 aa29.65■■■□□ 2.34
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 PSME1Q06323 249 aa29.62■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 SBNO1A3KN83 1393 aa29.62■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 TULP4Q9NRJ4 1543 aa29.61■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 ABCA3Q99758 1704 aa29.59■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa29.59■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 SLIT2O94813 1529 aa29.58■■■□□ 2.33
PSME3-210ENST00000590720 ARHGEF10O15013 1369 aa29.56■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 PRR36Q9H6K5 1346 aa29.56■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.55■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 WASLO00401 505 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP29.53■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 ATAD2Q6PL18 1390 aa29.52■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 LMOD2Q6P5Q4 547 aa29.52■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.52■■■□□ 2.32
PSME3-210ENST00000590720 UNC5CLQ8IV45 518 aa29.51■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 PLCH1Q4KWH8 1693 aa29.5■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 ALS2Q96Q42 1657 aa29.5■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 ITSN1Q15811 1721 aa29.49■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 GLI3P10071 1580 aa29.49■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 PLEKHG5O94827 1062 aa29.49■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.49■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 ATP7BP35670 1465 aa29.48■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.48■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 NWD2Q9ULI1 1742 aa29.47■■■□□ 2.31
PSME3-210ENST00000590720 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PSME3-210ENST00000590720 EP400Q96L91 3159 aa29.42■■■□□ 2.3
PSME3-210ENST00000590720 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa29.41■■■□□ 2.3
PSME3-210ENST00000590720 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa29.41■■■□□ 2.3
PSME3-210ENST00000590720 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.4■■■□□ 2.3
PSME3-210ENST00000590720 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
PSME3-210ENST00000590720 VPS72Q15906 364 aa29.38■■■□□ 2.29
PSME3-210ENST00000590720 CDK19Q9BWU1 502 aa29.38■■■□□ 2.29
PSME3-210ENST00000590720 NRAPQ86VF7 1730 aa29.37■■■□□ 2.29
PSME3-210ENST00000590720 FAM83GA6ND36 823 aa29.36■■■□□ 2.29
PSME3-210ENST00000590720 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
PSME3-210ENST00000590720 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms