RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-216ENST00000590105 STAC3Q96MF2 364 aa11.97□□□□□ -0.49
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPOAP1O95153 1857 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAK2O60296 914 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-216ENST00000590105 COL9A1P20849 921 aa11.96□□□□□ -0.49
EFTUD2-216ENST00000590105 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa11.96□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 PTPN5P54829 565 aa11.95□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 AMHR2Q16671 573 aa11.94□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 DPYSL4O14531 572 aa11.93□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 PROX2Q3B8N5 592 aa11.93□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 CLIP1P30622 1438 aa11.93□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 NECTIN2Q92692 538 aa11.92□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR37O15354 613 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 PHLDB1Q86UU1 1377 aa11.91□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP2K5Q13163 448 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 KCTD17Q8N5Z5 321 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa11.9□□□□□ -0.5
EFTUD2-216ENST00000590105 PDIA6Q15084 440 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 THSD4Q6ZMP0 1018 aa11.89□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 IRF6O14896 467 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa11.88□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PHF14O94880 888 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 WNT2BQ93097 391 aa11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM6BO15054 1643 aa11.86□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CFAP43Q8NDM7 1665 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.85□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX12PQ92771 950 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC102AQ96A19 550 aa11.84□□□□□ -0.51
EFTUD2-216ENST00000590105 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RAPGEF3O95398 923 aa11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 FBXW7Q969H0 707 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 CEP162Q5TB80 1403 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 HECW1Q76N89 1606 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ABCA9Q8IUA7 1624 aa11.82□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 GOLGA8CPA6NN73 597 aa11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 SERPINA10Q9UK55 444 aa11.81□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 PLCH2O75038 1416 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 NBPF3Q9H094 633 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 NEO1Q92859 1461 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 ARAP3Q8WWN8 1544 aa11.8□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 AKNAQ7Z591 1439 aa11.79□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC18Q5T9S5 1454 aa11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.78□□□□□ -0.52
EFTUD2-216ENST00000590105 GNPATO15228 680 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 BCAMP50895 628 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 EPAS1Q99814 870 aa11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 FYCO1Q9BQS8 1478 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 MCM6Q14566 821 aa11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 HIC1Q14526 733 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 FANCAO15360 1455 aa11.75□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 NUTM2FA1L443 756 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 AFAP1Q8N556 730 aa11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 FCHSD2O94868 740 aa11.71□□□□□ -0.53
EFTUD2-216ENST00000590105 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ANKK1Q8NFD2 765 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 TSKSQ9UJT2 592 aa11.7□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 RAD21O60216 631 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 ADGRL1O94910 1474 aa11.69□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.68□□□□□ -0.54
EFTUD2-216ENST00000590105 C3orf80F5H4A9 247 aa11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms