RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP35.83■■■■□ 3.33
SCAMP4-210ENST00000588555 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
SCAMP4-210ENST00000588555 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
SCAMP4-210ENST00000588555 PANK3Q9H999 370 aa35.81■■■■□ 3.32
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
SCAMP4-210ENST00000588555 PTCH1Q13635 1447 aa35.79■■■■□ 3.32
SCAMP4-210ENST00000588555 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa35.78■■■■□ 3.32
SCAMP4-210ENST00000588555 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa35.76■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 LMTK3Q96Q04 1460 aa35.74■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CABP2Q9NPB3 220 aa35.74■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP35.74■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CCER2I3L3R5 266 aa35.73■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRB2O60241 1585 aa35.7■■■■□ 3.31
SCAMP4-210ENST00000588555 CDK19Q9BWU1 502 aa35.69■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 ATAD2Q6PL18 1390 aa35.67■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa35.66■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNA6P17658 529 aa35.65■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 WASLO00401 505 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 HSPA2P54652 639 aa35.64■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.64■■■■□ 3.3
SCAMP4-210ENST00000588555 TMC1Q8TDI8 760 aa35.63■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.6■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 KNSTRNQ9Y448 316 aa35.59■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 NWD1Q149M9 1564 aa35.59■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 PARD3Q8TEW0 1356 aa35.58■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.57■■■■□ 3.29
SCAMP4-210ENST00000588555 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 RALBP1Q15311 655 aa35.55■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa35.55■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.54■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 STRCQ7RTU9 1775 aa35.53■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 ATP7BP35670 1465 aa35.52■■■■□ 3.28
SCAMP4-210ENST00000588555 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.51■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 USP32Q8NFA0 1604 aa35.51■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1W2PP64 1363 aa35.5■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC184Q52MB2 194 aa35.48■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 CABP1Q9NZU7 370 aa35.47■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 PRR36Q9H6K5 1346 aa35.47■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 NALCNQ8IZF0 1738 aa35.46■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa35.45■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
SCAMP4-210ENST00000588555 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa35.44■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.43■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC61Q9Y6R9 512 aa35.43■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.4■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 STRCP1A6NGW2 1772 aa35.39■■■■□ 3.26
SCAMP4-210ENST00000588555 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.38■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.38■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa35.38■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MRS2Q9HD23 443 aa35.38■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 CGNL1Q0VF96 1302 aa35.35■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 AKAP12Q02952 1782 aa35.33■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ITSN1Q15811 1721 aa35.33■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP13Q86W25 1043 aa35.33■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKARQ7Z5J8 1434 aa35.32■■■■□ 3.25
SCAMP4-210ENST00000588555 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.31■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 NSD2O96028 1365 aa35.31■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 NUTM2FA1L443 756 aa35.3■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 PLEKHG3A1L390 1219 aa35.29■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP2R1AP30153 589 aa35.26■■■■□ 3.24
SCAMP4-210ENST00000588555 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 KIF20BQ96Q89 1820 aa35.23■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa35.23■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.21■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 FYB1O15117 783 aa35.2■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 ACEP12821 1306 aa35.2■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa35.2■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 MORC1Q86VD1 984 aa35.2■■■■□ 3.23
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM94Q12767 1356 aa35.19■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 C14orf37Q86TY3 774 aa35.18■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.15■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 USP6P35125 1406 aa35.15■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.15■■■■□ 3.22
SCAMP4-210ENST00000588555 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.13■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa35.13■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 C19orf44Q9H6X5 657 aa35.13■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP35.12■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 SSH2Q76I76 1423 aa35.12■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 DCCP43146 1447 aa35.1■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 DMRT2Q9Y5R5 561 aa35.1■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC7Q96NW7 1537 aa35.07■■■■□ 3.21
SCAMP4-210ENST00000588555 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.06■■■■□ 3.2
SCAMP4-210ENST00000588555 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
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