RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-204ENST00000587718 POTEAQ6S8J7 498 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-204ENST00000587718 IFT172Q9UG01 1749 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-204ENST00000587718 LRP6O75581 1613 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-204ENST00000587718 C1orf167Q5SNV9 1468 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 SHPRHQ149N8 1683 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 NHSL1Q5SYE7 1610 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 PIK3C2GO75747 1445 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 ANP32CO43423 234 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-204ENST00000587718 TECPR2O15040 1411 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ABCC11Q96J66 1382 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM132EQ6IEE7 984 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 ORAI2Q96SN7 254 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 STK26Q9P289 416 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.32■■■■□ 3.25
CAPNS1-204ENST00000587718 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 LAMC1P11047 1609 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 WAPLQ7Z5K2 1190 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 NBPF8Q3BBV2 869 aa35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 MYOM2P54296 1465 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PNPLA6Q8IY17 1366 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 WASHC2AQ641Q2 1341 aa35.25■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CFAP70Q5T0N1 1121 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 SIRT1Q96EB6 747 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 KNDC1Q76NI1 1749 aa35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 CCDC7Q96M83 1385 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 RALGAPBQ86X10 1494 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-204ENST00000587718 ESCO1Q5FWF5 840 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-204ENST00000587718 NPHP3Q7Z494 1330 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-204ENST00000587718 AFF2P51816 1311 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-204ENST00000587718 NUTM2FA1L443 756 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-204ENST00000587718 FOXO3O43524 673 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-204ENST00000587718 PXDNQ92626 1479 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-204ENST00000587718 C8orf37Q96NL8 207 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRB1O14514 1584 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 DCAF11Q8TEB1 546 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 STAC3Q96MF2 364 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 FMN2Q9NZ56 1722 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 PRAM1Q96QH2 718 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 DLC1Q96QB1 1528 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 RXRBP28702 533 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 USP47Q96K76 1375 aa35.03■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAMTS2O95450 1211 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-204ENST00000587718 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF7Q2M1P5 1343 aa34.98■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 NGLY1Q96IV0 654 aa34.97■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
CAPNS1-204ENST00000587718 POGKQ9P215 609 aa34.95■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TRAK1Q9UPV9 953 aa34.94■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 KIF1AQ12756 1690 aa34.92■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 PHF8Q9UPP1 1060 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa34.91■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 KRT28Q7Z3Y7 464 aa34.89■■■■□ 3.18
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ADGRB2O60241 1585 aa34.88■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 GPRASP1Q5JY77 1395 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 USP21Q9UK80 565 aa34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.87■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 ANKARQ7Z5J8 1434 aa34.85■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 USP32Q8NFA0 1604 aa34.83■■■■□ 3.17
CAPNS1-204ENST00000587718 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.174e-10■■■■□ 22.9
CAPNS1-204ENST00000587718 CARD11Q9BXL7 1154 aa34.82■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 RGS12O14924 1447 aa34.81■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PSME1Q06323 249 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 BCL9LQ86UU0 1499 aa34.79■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PRR36Q9H6K5 1346 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 SBNO1A3KN83 1393 aa34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 WASLO00401 505 aaPredicted RBP34.78■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 ATRNO75882 1429 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 TNS3Q68CZ2 1445 aa34.77■■■■□ 3.16
CAPNS1-204ENST00000587718 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP34.73■■■■□ 3.15
CAPNS1-204ENST00000587718 TULP4Q9NRJ4 1543 aa34.72■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms